非生物逆境胁迫相关NAC转录因子的生物信息学分析.pdfVIP

西北植物学报．2012．32(3)：0454—0464 ActaBot．Boreal．—撕cident．Sin． 文章编号：1000—4025(2012)03—0454一II 非生物逆境胁迫相关NAC转录因子的 生物信息学分析 ’ 李 伟，韩 蕾 钱永强，巨关升，孙振元 (中国林业科学研究院林业研究所／国家林业局林木培育重点实验室。北京100091) 摘要：通过生物信息学手段．对22种NAC蛋白(14种非生物逆境胁迫相关NAC蛋白、8种涉及不同生物学功能 的NAC蛋白)进行氨基酸序列比对和系统发生树构建，对14种非生物逆境胁迫相关NAC蛋白氨基酸组成、理化 性质、亲／疏水性、保守结构域、亚细胞定位、二级结构及三级结构等进行了分析、预测。结果显示，22个NAC蛋白 中．非生物逆境相关的NAC蛋白聚成一类，其余NAC蛋白聚为另一类；非生物逆境胁迫相关的NAC蛋白序列分 析显示，N一端具有A、B、C、D、E5个保守的亚结构域，共同组成NAC结构域，C一端含有多个保守的酸性氨基酸位 点，具有转录激活功能，同时蛋白中含有多个丝氨酸(S)、苏氨酸(T)和酪氨酸(Y)磷酸化位点；非生物逆境胁迫相 关NAC蛋自主要亲水区域位于A、C、D亚域，大多定位于细胞核，个别定位于细胞质或线粒体，二级结构则以r螺 旋和p折叠片为主；拟南芥RD26和ANAC三级结构上的一致性暗示了功能上的相似。 关键词：非生物逆境；NAC转录因子；生物信息学 中图分类号：Q789 文献标志码：A BioinformaticsofAbioticStressRelatedNAC Factors Analysis Transcription LI Wei，HANI。ei’，Q1AN Yong—qiang，JUGuan—sheng，SUNZhen—yuan (ResearchInstituteof ofForestCultivation，State 100091。China) Forestry／KeyLaboratory ForestryAdministration·Beijing of22NAC NACtran- 14abioticstressrelated Abstract：Multiplealignment factors。including transcription and doneand factors8NAC factorsinvolveddifferent functions，was scription transcription biological phy— theamino andchemicaI treewas and of acid logenetic built．Analysisprediction composition，physicalprop— domain，the structure，sub—cellularlocaliza-