目标序列捕获及平行测序在临床耳聋基因诊断中的应用.pdfVIP

ChineseJournalofOtologyVol.12,No.1,2014 · 45 · ·耳聋基因诊断专辑 · 目标序列捕获及平行测序在临床耳聋基因 诊断中的应用 1,2 3 4 5 1,2 1 1 3 1,2 苏钰 汤文学 代志瑶 高雪 王国建 黄莎莎 康东洋 林曦 戴朴 1 解放军总医院耳鼻咽喉头颈外科（北京 100853） 2 解放军总医院海南分院耳鼻咽喉头颈外科（海南572000） 3 美国Emory大学耳鼻咽喉科（亚特兰大） 4 解放军总医院第一附属医院耳鼻咽喉头颈外科（北京 100048） 5 解放军二炮总医院耳鼻咽喉科（北京 100088） 【摘要】目的利用目标序列捕获（Targetedsequencecapture）、生物编码（Barcode）及大规模平行测序（Massively parallelsequencing，MPS）技术，对遗传性耳聋患者进行分子病因学研究，探索低成本、多基因、多样本的耳聋基因检测 在临床应用的可行性。方法 利用Illumina测序平台对来自解放军总医院聋病分子诊断中心88例（来自61个家系）具 有明确家族史且常见耳聋基因检测阴性的耳聋患者，以及8例阳性对照患者进行42种基因的目标序列捕获、Barcode 和MPS，并对测序结果进行生物信息学分析。结果 利用上述方法在88个个体中大于一人入组家系中发现了10个家 系8个基因（TECTA、DFNA5、CDH23、USH1C、MYO7A、POU3F4、SLC26A4、EYA4）14个位点的致病性突变。准确验证 了8个阳性对照。大于一人入组家系的致病基因检出率明显高于单人入组家系。结论 高通量测序的发展为遗传性 耳聋的诊断带来了巨大的机遇。目标序列捕获、Barcode、MPS的结合进一步提高了测序的准确性、降低了测序成本， 同时生物信息学的进步，将促进低成本、多基因、多样本的临床耳聋基因检测成为可能。 【关键词】遗传性耳聋；目标序列捕获；生物编码；平行测序；生物信息学 【中图分类号】R764.04; R764.43 【文献标识码】A 【文章编号】1672-2922 （2014 ）01-05 Targeted gene capture and massively parallel sequencing to identify causative genes mutations in clinical genetic testing for hereditary hearing loss SUYu1,2 3 4 1,4 1,2 1 ,TANGWenxue ,DAIZhiyao ,GAOXue ,WANGGuojian ，HUANGShasha, KANGDongyang1,LINXi ，DAIPu3 1，2 1DepartmentofOtorhinolaryngology,HeadandNeckSurgery,PLAGeneralHospital,Beijing,P.R.China,100853 2DepartmentofOto