血清蛋白质质谱与支持向量机模型在胰腺癌检测上的应用.pdfVIP

血清蛋白质质谱与支持向量机模型在胰腺癌检测上的应用.pdf

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血清蛋白质质谱与支持向量机模型在胰腺癌检测上的应用.pdf

第41卷第3期 浙江大学学报(医学版) Vol4l No3 0F 2012年 JOURNALZHEJlANGUNIVERSITY(MFDICALSCIENCES) 2012 u.edu.cn/med http:∥www.jounlals.zj 血清蛋白质质谱与支持向量机模型 在胰腺癌检测上的应用 竺杨文1,王跃东1,叶再元1,胡汛2,余捷凯2 (1.浙江省人民医院,浙江杭州310014; 2.浙江大学医学院附属第二医院肿瘤研究所,浙江杭州310009) [摘要]目的:为提高胰腺癌的早期检测率筛选新的标志物,应用蛋白芯片结合表面增强激光 解吸电离飞行时间质谱(sELDI—ToF—MS)技术建立胰腺癌的血清蛋白质质谱模型。方法:用弱阳 腺炎,20例健康人。用支持向量机方法建立胰腺癌和健康人以及胰腺癌和胰腺炎的辨别模型。结 果:胰腺癌和健康人辨别模型用了3个蛋白质峰,辨别的敏感性和特异性均为100%,而胰腺癌和 胰腺炎辨别模型用了5个蛋白质峰,辨别的特异性和敏感性分别为95.5%和93.5%。结论: sELDI—TOF—Ms技术结合生物信息学方法检测胰腺癌具有较高的敏感性和特异性。 [关键词]胰腺肿瘤/诊断;蛋白质组学;光谱法,质量,基质辅助激光解吸电离;肿瘤标记,生物 学;敏感性与特异性;血蛋白质类/分析 [中图分类号]R735.9 [文献标志码]A 【文章编号] ofserum in of cancer Applicationproteinfingerprintdiagnosispancreatic zHu xun2,Yu Yang-wenl,wANGYue—don91,YEzaj-yuanl,HUJie—kai2(1.脚口厅聊眦矿&肥r口f 4历z谊£8d月却i脚,zh咖增踟iMs妙Scbof旷胁如i珊,砒,咖oⅡ310009,吼i舳) establish8emm modelfor of 0bjecave:To [Abstract] proteinfingerprint eallydiagIlosisp锄creatic cancerwithsu由ceenh锄cedlaser time0f desorption/ionizationnight-mss bioinfonnatics Atotalof73 were inthis MS)and Methods: techniques. 8amplesanalyzed 8tudy, 3lcasesof c8sesof 20 were cancers,22 including pancreatic pancreatitis明dhealthyindividuals.Samples first SELDI—TOF—MSandtwo ofdif佑rentiationmodelwereconstnlctedwith aIlalyzedby pattems support vectormachinearithmeticmethod. l model c舳cer ReslIIts:The

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