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宁夏绵羊脑组织博尔纳病病毒的自然感染状况_临床医学论文
宁夏绵羊脑组织博尔纳病病毒的自然感染状况_临床医学论文
【摘要】 目的了解宁夏地区绵羊脑组织博尔纳病病毒(Borna disease virus,BDV)的自然感染情况,并分析其与德国马源性标准病毒株He/80的同源性。方法应用荧光定量巢式逆转录PCR(FQ-nRT-PCR)和RT-PCR分别检测宁夏地区163例绵羊脑组织中BDV p24、 BDV p40基因片段,并对BDV p24阳性扩增产物进行测序,与国外标准病毒株进行比较。结果 163例绵羊脑组织中6例BDV p24、BDV p40均阳性,阳性率为3.68%(6/163)。测序后经基因序列比对,本实验检测阳性BDV p24 片段的核苷酸序列与He/80 同源性为100%。结论 宁夏地区绵羊脑组织中可能存在动物源性BDV的隐性感染,阳性BDV p24核苷酸序列与He/80具有高度同源性。
【关键词】 博尔纳病病毒BDV p24基因;BDV p40基因;荧光定量巢式逆转录PCR;绵羊脑组织
博尔纳病病毒(Borna disease virus,BDV)是一种高度嗜神经的非节段性负链RNA病毒,可以引起散发的脑脊髓炎。BDV可以感染从鸟类到非人灵长类的广泛的动物种属,表现出神经病学和行为学的异常[1]。人类的BDV感染可能与部分神经精神疾病的发病有关[2]。我国新疆、重庆、台湾等地区的马和牛等已报道存在散在的BDV自然感染。大量的研究表明在德国、日本、美国的精神病和神经病患者中存在BDV特异性抗体[3]。本课题组前期研究已证实宁夏地区牛、羊的外周血单核细胞(peripheral blood monouclear cells,PBMC)及病毒性脑炎病人PBMC和脑脊液中存在BDV[4-6],说明宁夏地区存在BDV的自然感染,但目前还没有宁夏地区绵羊脑组织BDV检测的报道。本研究通过对宁夏163例健康成年绵羊脑组织进行BDV感染的检测,现报告如下。
1材料和方法
1.1研究对象本研究中163例成年绵羊均来自宁夏地区,每例取颞叶脑组织约50g,于-80℃保存备用。
1.2试剂Trizol RNA提取抽提剂(购自BioFlux),荧光定量PCR检测试剂盒(购自广州达晖生物技术有限公司)。BDV p24重组质粒由重庆医科大学神经病学研究中心提供。
1.3仪器752紫外光栅分光光度计(上海第三分析仪器厂);Bio-Rad PCR仪(日本);Heraeus低温高速离心机(德国);Rotor-Gene 6000荧光PCR仪(澳大利亚);SANYO ULTRA LOW冰箱(日本)。
1.4BDV p24基因片段的引物和探针根据GeneBank中BDV的第二开放阅读框(ORGⅡ)区核苷酸序列设计了2对引物:外引物p1为5-TCAGACCCAGACCAGCGAA-3,p2为5-ATCTGGGGATAAATGCGCG-3;内引物p1为5-CCCTCCAAGTGGAAACCAT-3,p2为5-CAGTATCTT GATGTTCTCGCCA-3; 荧光探针为5-(FAM)- TCAGCGGTGCGACCACTCCGATAGC-(TAMRA)-3(由上海英骏生物有限公司合成)。PCR产物长度为86bp。
1.5BDV p40基因片段的引物根据BDV p40 蛋白的核苷酸序列设计了1对引物,上游引物:5-AGTCACCGCGCGATAGTTT-3,下游引物:5-CGACAGGTAGGATTCACGAGGC-3,由上海英骏生物有限公司合成。PCR产物长度为154bp。
1.6方法
1.6.1脑组织总RNA的提取及质量检测将-80℃保存的绵羊脑组织取适量放入1.5mL EP管中,按BioFlux的Trizol RNA提取试剂盒说明书提取总RNA, -80℃冰箱保存备用。随机取上述提取RNA样品4份,用紫外分光光度计测定OD260、OD280,并计算二者的比值分析其纯度。然后进行1%琼脂糖凝胶(含溴化乙锭浓度为0.5%)电泳,以3~4V·cm-1电压电泳25min,分析RNA完整性。
1.6.2BDV p24质粒标准曲线制作将鉴定好的质粒测定OD值,计算出拷贝数,按107、106、105、104、103 、102拷贝数·μL-1的浓度梯度稀释作为阳性模板,在Rotor-Gene 6000荧光PCR仪上进行扩增,每8s检测1次PCR产物的量(即反应管中荧光值Rn的变化), 每次六个梯度阳性对照均扩增成功,根据阳性定量标准模板的扩增情况绘制标准曲线,扩增曲线呈S形,阴性对照无荧光量改变。
1.6.3FQ-nRT-PCR检测BDV p24基因片段逆转录反应:在含样本RNA的EP管中加入下列逆转录体系进行反应:5×逆转录缓
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