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SPM中文手把手教程:多种数据转换的方法 更有进步和乐趣.写教程是最艰巨的工程,许多错误和遗漏,欢迎大家批评补充.?? ?? ? ? ?? ?? ? 使用SPM进行数据处理前,必须先将其它档案格式转换成spm可以读取的Analyze档案格式,包含.img档和.hdr标头档,相关的转档软件有XMedCon和MRIcro.? ?? ?? ? 1.利用AFNI数据转换? ?? ?? ? 首先使用afni的三维数据重建: to3d -time:tz 177 20 2s altplus * 生成+orig文件? ?? ?? ? 然后: 3dAFNItoAnalyze -4D -orient LPI *epi+orig? ?? ?? ? 将生成*.hdr与*.img文件. (*代表你所用的任意文件名)? ?? ?? ? ? ?? ?? ? 然后打开MRIcro软件:? ?? ?? ? 选择要转换的hdr,img文件, processing, ok.? ?? ?? ? 选择面板上部 File --Save as 4d to 3d --- Save as intel ---Save (这里有点忘了:))? ?? ?? ? ? ?? ?? ? 2.直接用MRIcro转换:(此部分转自核医学论坛)? ?? ?? ? 1。点Import/convert foreign to analyze,在出现的对话框中，number of files为你的数据的总文件数，slice increment＝1，volume increment＝0，volumes为你的实验的volume数。填好后，先点design，后点select，然后选中你的数据的第一个文件。然后保存。? ?? ?? ? 2。点file/open，打开刚才保存的img文件。? ?? ?? ? 3。点file/save as ...[rotate/clip/format/4D-%26gt;3D],然后点击“save intel”。即可? ?? ?? ? 这样保存后的文件就可以被SPM处理了? ?? ?? ? ? ?? ?? ? MRIcro的Import-%26gt;Convert中的volume可以理解为完整头部像数目。在从GE Signa 1.5T 中获得的fMRI Dicom数据中，是1个slice存成一个dicom image文件，因此，volume数，也就是整个dicom image目录所包含的完整头部扫描图像数目，等于 整个dicom image目录下所有单个slice dicom image文件除于实验时设置的slices数。? ?? ?? ? 简单地说，一个fMRI实验，层数为16，获得512个slice dicom image文件，则其volumes=512/16=32。? ?? ?? ? ? ?? ?? ? 注: SPM的dicom import是可以导入dicom文件，但导入的这些图像还是2D的，不是3D的，不能用于fMRI分析。要先把2D的slice重建成3D的volume，就可以用于fMRI分析了。MRIcro可以干这活:? ?? ?? ? 先把3次BOLD的文件分别移动到三个不同的文件夹里，然后用MRIcro依次导入转换每个目录的slice dicom file成一个ANALYZE文件（4D的），再另存为多个img，hdr文件（4D－%26gt;3D），个数就是volume数，也就是目录下文件数除于层数。（这是针对从GE Signa 1.5T 上刻录的光盘上的dicom格式数据来讲的，其它机器的数据存放方式可能有所不同，请相应具体分析）? ?? ?? ? ? ??? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ? 3.使用XMedCon转换PET数据:? ?? ?? ? ? ?? ?? ? 将有Brain影像的档案由MO片读出,档案格式为 .v档转.? ?? ?? ? 例如:Chang_10_9e2_de11.v_826420_49y? ?? ?? ? Chang_10_9e2_de11.v为档名,826420为病例号,49y为年龄.? ?? ?? ? 使用XMedCon将.v档转为analyze档.? ?? ?? ? 打开XMedCon:? ?? ?? ? 选film打开open档案:? ?? ?? ? 选择要转档的档案后,按OK:? ?? ?? ? 出现影像:? ?? ?? ? 再选film并save as analyze:? ?? ?? ? 储存於设定的资料夹后按OK:? ?? ?? ?