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NCBI检索方法.ppt

NCBI的检索方法 1.NCBI数据库 美国国家生物技术信息中心NCBI 1.NCBI数据库 NCBI的数据库是多种生物信息学数据库的集合。 NCBI对其管理下的数据库进行了系统整合,并建立了各数据库之间的信息互联,在检索过程中只要定位其中的一条记录,通过数据库之间的超链接就可以定位其他的相关链接。 2.NCBI数据库检索系统Entrez Entrez简介 Entrez是基于万维网的数据检索系统。 Entrez由NCBI开发,是一个综合的数据库检索系统,运用简单的布尔算符,可在NCBI所有数据库系统中进行文本搜索。 2.NCBI数据库检索系统Entrez 检索策略表达式的建立与编辑 特征栏 4.2NCBI数据库检索系统Entrez 2.NCBI数据库检索系统Entrez 结果输出、显示选项 2.NCBI数据库检索系统Entrez Entrez检索策略的定制 核酸序列数据库的检索 核酸库的结果显示 默认的显示结果类型 分类列表 这些序列的功能一般是通过生物信息学分析得到的 ,未经过实验验证 通过BLAST寻找该 序列的相似序列 可以将检索结果按PDB 结构数据库的登录号列表 登录http://www.rscb.org/ 利用PDB的ACCESSION号即可获得相应的PDB的文件 3.Entrez检索策略的定制 Entrez蛋白专家数据库Swiss-Prot的检索 以人的细胞色素C蛋白序列为例 专家库 相关信息准确且全面

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