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SadtlerSuite综合软件包.doc
Sadtler Suite综合软件包使用说明
何林涛
(北京微量化学研究所,北京 100091)(本文已发表在现代科学仪器 4, 35 ,1999)
Sadtler公司以编辑出版各种标准谱图集如红外(IR)、紫外(UV)、核磁共振(NMR)等谱图以及相应的数据库而闻名,1978年Sadtler与著名的红外光谱制造商Digilab公司一起加盟Bio-Rad Laboratories Inc., Sadtler继续光谱数据库的发展和光谱软件的开发。1996年Sadtler收购了SoftShell公司,SoftShell的著名产品是ChemWindow,可以绘画化学结构、反应式、实验装置。1998年Sadtler为化学家推出Sadtler Suite综合软件包,它由四个子软件组成:SearchMaster 6.0、IR Mentor Pro 2.0、ChemWindow 6.0 和SymApps 6.0;内容包括红外光谱检索、红外光谱智能解释、13C-NMR化学位移预测、质谱(MS) 解释、化学结构和反应装置的绘画、三维立体化学和点群计算,此外,还有2500张标准红外光谱数据库和4500个化学结构库供红外光谱检索和结构检索。Sadtler Suite为化学家分析谱学数据和化学结构方面提供了有利工具,实现从光谱到结构和从结构到光谱的互通途径。本文简单介绍Sadtler Suite综合软件包的功能,阐明当代计算机对光谱工作者和化学家的帮助。
第一节??IR SearchMaster 6.0
IR SearchMaster 6.0 是最新版本的红外光谱检索软件,可在Windows 95/98 或NT下运行。IR SearchMaster 6.0 提供了一个非常容易使用的界面,三组工具栏(Toolbars:Standard, Search, Spectrum)可直接启用大部分常用的命令,见图1 。SearchMaster 6.0 可用多种检索方法对未知光谱进行检索。检索方法有光谱检索(全光谱范围Full spectrum或选择范围Limited Range)、峰检索、化合物名称检索、化合物理化性质检索、结构检索。这些方法可单独使用,也可以几种检索方法相互结合同时进行,见图2。 SearchMaster 6.0的光谱检索有两种最常用、有效的数学运算方法:Euclidean Distance(欧氏距离,与最小二乘法相近)和1st Derivation Eulidean Distance (一阶微分欧氏距离)。化合物理化性质检索中包括:熔点、沸点、分子量、分子式、CAS登记号、闪点、折光指数、分解温度等百余项参数的检索。
SearchMaster 6.0 可以直接调入主要的红外仪器和光谱软件公司格式的光谱数据,进行光谱处理和光谱检索,并可以这些格式存储数据。SearchMaster 6.0可直接处理的仪器公司格式有Bio-Rad /Digilab (伯乐)、Bruker(布鲁克)、Galactic、Jasco、JCAMP格式、Jeol、Labcontrol、Mattson、Nicolet(尼高力)、Perkin-Elmer(P-E)、Shimadzu(岛津)、及其他格式。
SearchMaster 6.0可对光谱进行预处理,然后选择适当的光谱数据库进行检索,提高检索结果的命中率,光谱处理方法包括:平滑(Smoothing)、基线校正(Baseline Correction)、ATR校正、差谱(Spectral Subtraction)、归一化(Normalization)及光谱范围处理(Truncation, Flatline)等。
?图1. SearchMaster 6.0 工作界面
?图2. SearchMaster 6.0 中的检索方法:Combination, Spectrum, Peak, Properties, Name, Structure Search
? SearchMaster 6.0可以同时显示无限多张光谱,显示方式有重叠(Overlay)、偏离(Offset)、堆叠(Stacked)等方式,并可同时显示标准谱图的化学结构和相关的理化性质。SearchMaster 6.0还可将光谱图发送到ChemWindow下对光谱图作标注,随意方便地作出各种格式的报告文件, 见图3。SearchMaster 6.0 也可与IR Mentor Pro直接相连对未知光谱进行功能团分析。SearchMaster 6.0的用户还可以建立用户自已的Sadtler格式光谱数据库,供光谱检索之用。
?图3. SearchMaster 6.0 与ChemWindow 6.0 的相连
第二节IR Mentor Pro
? IR Mentor Pro是
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