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- 2017-08-15 发布于河南
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UniProt类数据库简介.doc
UniProt类数据库简介
1. UniProt
全球蛋白质资源(Universal Protein Resource,UniProt)是全球有关蛋白质方面信息最伞面的资源库。是蛋白质序列以及功能信息的集中资源,且其具有最小的冗余。UniProt是对PIR、TrEMBL以及SwissProt的信息进行组合而构成的。UniProt提供了完全分类的、有丰富且准确注释信息的基于知识的蛋白质序列信息,且有广泛的交叉引用以及多种查询界向。出于方便序列查询,UniProt同样提供了多个非冗余序列数据库。
UniProt由三部分内容组成,分别是UniProtKB、UniRef和UniParc,
每个部分偏向于不同的用途。
1、UniProtKB(the UniProt knowledgebase)是基于知识的UniProt,通常也简称为UniProt,它汇聚了蛋白质的主要信息,包括蛋白质功能、分类以及交叉引用。UniProtKB包含两个部分:一部分是人工注释的记录,这部分注释信息是来自于文献信息和在专家监督下进行计算机分析而得到的(记为UniProt,SwissProt);另外一部分是直接利用计算机程序获得的记录信息。此类信息尚未有手工注释(记为UniProt/TrEMBL)。在SwissProt或TrEMBL中没有找到的PIR—PSD记录也被存放到UniProtKB中,并且与SwissPro
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