蛋白质组学在精神科学领域应用.pdfVIP

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蛋白质组学在精神科学领域的应用 冯坤综述 蒙华庆审校 【摘要】蛋白质组学是在人类基因组计划研究发展的基础上形成的新兴学科,蛋白质组主要是指一个基因组、一种生物或一 种细胞/组织所表达的全套蛋白质,它主要研究蛋白质的特性,包括蛋白质表达水平、氨基酸序列、翻译后加工和蛋白质的相互作 用,在蛋白质水平上了解细胞的各种功能、生理生化及疾病的病理过程等…。蛋白质组学集中于动态描述基因调节,对基因表达的 蛋白质水平进行定量测定,鉴定疾病、药效对生命过程的影响,以及解释基因表达调控的机制“。。 以往与精神科疾病相关的蛋白质研究主要集中在考察某个或某些基因、蛋白的表达及可能作用,但这种对单个蛋白质或某几 种蛋白质进行研究的方式难以形成一种整体观,难以系统全面的了解疾病本质。蛋白质组学的出现,使得在整体、动态、系统水平 上对蛋白质进行研究成为可能,从而为精神科疾病领域的深入研究提供了新平台。本文就蛋白质组学在精神科学领域的最新研究和 应用进展作一综述。 【关键词】蛋白质组学精神疾病综述 1蛋白质组学的关键技术 随着基因组学研究的不断深入,在基因组测序、蛋白质 序列测定和结构解析等实验的基础上,产生了大量有关 蛋白质组学的研究主要依赖三大技术作为支撑:双 生物分子的原始数据,这些原始的数据需要利用现代计 向凝胶电泳分离蛋白质,生物质谱技术鉴定蛋白质,以 算机技术进行收集、整理、管理以便于检索使用,生物 及利用生物信息学技术进行蛋白质相关数据的分析。 信息学应用而生,其研究重点集中在核酸和蛋白质两个 1.1双向聚丙烯酰胺凝胶电泳技术 方面。生物信息学数据库从广义上主要分为两大类,即 双向聚丙烯酰胺凝胶电泳技术(two—dimensional 基本数据库(又称一级数据库)和二级数据库。基本数 PAGE)是 polyacrylamidegelelectrophoresiS。2D 据库中主要包括原始数据和对这些数据进行的生物学解 目前蛋白质分离的主要技术,具有高通量,重复性好, 释,如DNA序列、蛋白质序列和蛋白质结构等信息;二级 敏感性高的蛋白质分离技术,可以同时分离和定量成千 数据库则主要是对基本数据库进行分析、提炼加工后形 上万种蛋白质。第一向电泳利用固相pH梯度 成的,使得基本数据库的使用更加方便,如真核生物启动 (immobilizedpHgradient,IPG)胶条进行等电点聚焦 子数据库(eukaryotiC promoter 电泳,将不同等电点的蛋白质分离; 第二向在第一向 白质序列中的共同结构和功能基序数据库(PROSITE 的垂直方向进行SDS2PAGE电泳,从而将蛋白质根据其等 电点和分子量的差异在凝胶上分离成独立的蛋白质…’ 的二级数据库,这类数据库在实践中往往有更为广泛的 “。为避免不同凝胶之间的差异对结果分析带来的困 难,发展了差异凝胶电泳技术(differentialgel 数据库,能提供多种蛋白质数据,如蛋白质功能、结构 electrophoresiS),将不同蛋白样品用不同激发波长

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