塔里木盆地放线菌数据库硕士论文.docVIP

塔里木盆地放线菌网络数据库的建立 生物化学与分子生物学， 2011， 硕士 【摘要】 放线菌是寻找和发现天然生物活性物质、具开发潜力的一类有独特价值的微生物资源。本项目主要以前期研究获得的塔里木盆地放线菌菌种资源信息为研究对象,按照《微生物菌种资源描述规范汇编》中对放线菌菌种资源描述的规范进行基本信息、特征特性信息和图像信息的收集和实物整理,采用网络技术和数据库技术,构建了基于Web的塔里木盆地放线菌网络数据库。本研究主要内容包括:以Linux为操作系统、Apache为Web服务并配置支持PHP、CGI等脚本、以MySQL提供数据库服务的B/S构架,构建网络数据库的操作系统和服务平台环境;根据放线菌的信息特点设计数据库的表单及结构,结合PHP脚本语言实现菌种信息检索,包括菌种编号、保藏号、菌种名等相关信息的查询,同步实现数据资源网络化和信息、实物的共享。另外根据微生物资源研究的特点,集成了基于BLAST的序列比对,基于Primer 3的引物设计、基于Refbase的文献检索等功能。设计并实现了塔里木盆地放线菌网络数据库平台,不仅能够服务于本实验室放线菌资源的保藏、研究,还能满足序列分析、引物设计等常规功能,具有一定的实用价值。本课题的完成,不仅为实验室放线菌资源的开发提...?更多还原 【Abstract】 Actinomycetes are sort of unique biological resources which can be used to find out natural biological active substance and has high development potential. This project mainly makes use of Actinomycetes strains information that are already obtained in earlier research, and follow the description standard of Actinobacteria strains resource basic information written in揇escription standard compiled of microorganism strains resource攖o collect and sorting corresponding information. Use network tech...?更多还原 【关键词】 塔里木盆地； 放线菌； 数据库； 【Key words】 Tarim basin； Actinomycetes； database； 摘要 4-5 Abstract 5 第一章 前言 9-23 1.1 生物数据库的出现和发展 9-13 1.1.1 生物学的发展和人类基因组计划 9 1.1.2 生物信息学的出现和发展 9-10 1.1.3 生物数据库的发展 10-11 1.1.4 生物数据库的主要类型 11-12 1.1.5 生物数据库的特点和应用 12-13 1.2 数据库技术和Web 数据库 13-16 1.2.1 数据库的发展历程和架构 13-14 1.2.2 数据库的发展趋势和网络数据库 14-16 1.3 数据库技术在生物方面的应用 16-17 1.3.1 数据库的集成 16 1.3.2 数据库脚本索引 16-17 1.4 微生物菌种资源保藏的现状 17-20 1.4.1 国外的研究现状 17-19 1.4.2 国内的研究现状 19-20 1.5 论文的设计思路 20-23 1.5.1 研究意义 20-21 1.5.2 设计思路 21-22 1.5.3 主要研究方案 22 1.5.4 技术路线 22-23 第二章 放线菌网络数据库的需求分析与环境构建 23-34 2.1 放线菌网络数据库的需求分析 23 2.2 放线菌网络数据库的体系结构 23-25 2.2.1 整体结构关系的确立 23-24 2.2.2 采用B/S 架构模式 24-25 2.3 放线菌网络数据库的功能设计 25-26 2.3.1 放线菌数据库的检索和管理 25 2.3.2 放线菌数据库的功能扩展 25-26