茶树EST-SSR标记的开发与其育种利用.pdfVIP

全国植物分子育种研讨会摘要集 茶树EST．SSR标记的开发及其育种利用 陈亮，马春雷，姚明哲 (中国农业科学院茶叶研究所茶树资源与改良研究中心／国家茶树改良中心，浙江杭州，310008) 通过对茶树品种龙井43新梢和幼根eDNA文库进行测序，共获得了8000多条EST序列。拼接 5390个。利用SSR搜索软件对contig进行分析， 并去除冗余序列后，获得总长为3318kb的contig 中有1个SSR。不同重复类型在茶树中的分布频率差异较大，其中二核苷酸重复出现的频率最高， 其次是三核苷酸。根据搜索到的微卫星序列，共设计合成了576对EST-SSR引物。通过反应条件优 化和多态性鉴定，共筛选出稳定性好、多态性高的EST—SSR引物200多对。 利用这些自主开发的EST-SSR标记，开展了茶树核心种质分子鉴定、遗传多样性研究，并将在 茶树SSR标记连锁图谱的构建、茶树品质和农艺性状QTL的关联分析及定位研究中得到进一步利用。 行了检测，在供试资源中共检测到87个等位基因，平均每个引物所检测到的等位位点为3．2个。 多态性信息量(朋O变化范围在0．II一0．75之间，平均值为0．55。根据聚类结果，进一步分析了种 质的遗传代表性，从414份种质中筛选出360份资源作为我国茶树