DENV2 海南分离株NS1 全序列测定和生物信息学分析.pdfVIP

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2017-08-13 发布于北京
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2009年19(3) 生物技术 l 论著 RESEARCHn心ERS DENV2海南分离株NSl全序列测定和生物信息学分析周俊梅，方丹云，梁瑜，尹悦，江丽芳’ (中山大学中山医学院微生物学教研室，广东广州510080) 摘要：目的：对登革病毒2型海南分离株NSl全序列进行测定和生物信息学分析，了解其系统进化和分子流行病学特征。方和复杂性，对132一Hainan株NSI基因及其编码蛋白信息特征的了解，有助于进一步研究其基因特征与病毒毒力的关系。关键词：登革病毒；NSI基因；生物信息学中图分类号：Q785 文献标识码：A 文章编号：1004—311x(2009)03一OOOl一03 TheGene DeterminationandBioinformaticofthe Sequence Analysis Hainan Protein1 of 2VirusStrainIsolatedin Dengue ZHOU Jun—mei，FANG Dan—yun，L圳GYu，Y矾Yue，JLANG“一fang’ ofMedical Medical (DepartmentMicrobiology，BasicCollege，SunYat一蛐University，Guangzh叫510080，China) and theentire目。印】enceoftheNSl of 2virus8trainisolatedinI-IainanwhichistOunderstand Abstmct：Objective：Determineanalyze genedengue thecharacteristicofitsmolecularevohtioli．Method：r11陀nueleotidesofNSlofD2一Hainanwas RT—PCRandthe ampLifiedby sequexle沱will8 determined method．Thenthe andthe were DAS Sarlger BLASt，MEGA，ChstalX，nnfhdict，HNN，and by gene encodingproteinanalyzedby 踟fh忸陀．Result：Itshowedthatthewholenueleofide ofD2一HainanNSlwas1 andhadthe withthatofNGC 8equenoe 056bp 95％homology strain．ItW8．8rIl06t toChina04strainwiththe 99．3％．Bioinformaticstherewere352deducedaminoacidsof do,ely homology analysisproved NSl andit8haredthetwelve conserved out andbioinfor- protein highly cysteinesequenceamongflavivilM．se8．Condu正on：Bye∞yingsequencing matiesof researc