KARI 酶抑制剂的虚拟筛选, 合成及生物活性研究.pdfVIP

第4卷 第9期 2009 年 9 月 中国科技论文在线 Sciencepaper Online 1 KARI 酶抑制剂的虚拟筛选、合成及生物活性研究 王宝雷，陈沛全，刘幸海，李永红，李正名 （南开大学元素有机化学研究所，元素有机化学国家重点实验室，天津300071） 摘 要：本文在菠菜KARI酶复合物 0.165 nm高分辨率晶体结构基础上，利用分子对接方法对ZINC/drug-like小分子三 维数据库进行虚拟筛选，得到了 1000 个与KARI酶结合能较低的小分子结构信息，并从中选取部分小分子化合物进行 合成或购买，进而测试了其除草生物活性。结果表明，17 个化合物中，化合物 2 ，3 ，14 和 15 在 100 µg/mL浓度下对 油菜胚根的生长抑制率可达 72.1 % ~ 93.9 % ，而化合物2 和 3 对双子叶植物油菜和单子叶植物稗草均具有较好的生长 抑制活性。初步离体测试表明化合物在 100 µg/mL浓度下大多具有一定程度的KARI酶抑制活性。 关键词：酮醇酸还原异构酶；虚拟筛选；生物活性 中图分类号：O 621 ；O 626 文献标识码：A 文章编号：1673－7180(2009)09 －0000 －0 Studies on the Virtual Screening, Synthesis and Biological Activity of KARI Inhibitors Wang Baolei ，Chen Peiquan ，Liu Xinghai ，Li Yonghong ，Li Zhengming (Elemento Organic Chemistry Institue, State-Key Laboratory of Elemento-Organic Chemistry,Nankai University, Tianjin 300071, China) Abstract: In this paper, based on the reported 0.165 nm high resolution crystal structure of spinach KARI complex, 1000 molecules with low binding energy toward KARI were obtained from ZINC/drug-like 3D database virtual screening, using molecular d ℃king method. According to the structural information provided, several compounds have been synthesized or purchased and bioassayed. Among which 17 compounds, 2, 3, 14 and 15 showed 72.1 % ~ 93.9 % inhibitory activity on rape (Brassica campestris) roots at 100 μg/mL concentration. Meanwhile, 2 and 3 showed favourable herbicidal activities on both di-cotyledonous rape and mono-cotyledonous barnyardgrass (Echin ℃hloa crusgalli) in greenhouse tests. Most of compounds showed certain in vitro inhibitory activity on rice KARI at a test concentration of 100 µg/mL in preliminary bioassay. Key words: KARI ；virtual screening ；biological activity