基于多策略生物医学本体映射方法及研究.pdfVIP

2012年学术年会论文集 基于多策略的生物医学本体映射方法研究’ 方 安钱 庆 洪 娜 吴思竹 (中国医学科学院医学信息研究所北京100020) 摘要：本文在细致调研本体映射相关方法的基础上，重点分析了本体映射的整合方法，并结合生 物医学领域的有利资源PubMed和UMLS，开展了基于多策略的生物医学本体映射方法研究，从词形、语 义、属性和背景资源的角度设计了本体映射的多维计算角度，进一步实现了本体映射的实验和验证。 关键词：本体；本体映射；相似度；语义；多策略 on Biomedical Methodsbased OntologyMapping Study Multi——Strategy Wu An Na Sizu Fang QianQingHong InstituteofMedicalInformationofChinese ofMedical 1 Academy Sciences，Beijing00020，China the detail ofrelatedworksabout basisof Abstract：On investigation ontologymapping，first，welayed the on the combinedkindsofbeneficialsharedre- emphasisanalyzingintegratedmappingmethods，also sourceinbiomedical asPubMedand thenwe our domain，such UMLS，and developedontologymapping methodbasedon whichare from and infor— multi—strategydesignedlexcical，semantic，propertybackgroud mation．At andevaluatearecarriedout． last，experiment Keywords：Ontology，Ontology 1 引言 随着本体技术的研究和实践，目前已经存在许多推向应用的领域知识本体，但由于编码格式、不 同机构与编制者，专业知识认知差异、语义粒度、语种与术语差异等多方面因素导致本体之间普遍存 在异构现象，在生物医学领域大量的本体资源中，此类现象更是普遍。生物医学作为一个内在联系密 切的知识体系，更是迫切需要对这些异构资源进行映射和整合。本体映射是实现语义互操作的基础， 基于本体之间的映射关系，可以实现多种异构资源的跨数据集查询，数据转换以及知识推理。 本文针对生物医学领域本体资源的特点与现状，归纳总结并提出适用于生物医学领域的本体映射 思路与方法，该方法可以支持大部分生物医学领域本体的映射，为生物医学资源的整合，异构资源的语义 互操作，分布式资源的共享与应用提供了基础和铺垫，为大规模生物医学知识共享、知识组织体系的整 合、发布、语义检索等上层应用提供了技术支撑。因此，开展生物医学本体映射研究具有重要的意义。 2 相关研究 2．1 当前本体映射技术方法 按照JeromeEuzenat和PavelShvaiko的归纳，按照方法的粒度或方法输入的数据表示形式，当前 +本文系中国医学科学院医学信息研究所基本科研业务费专项“生物医学本体映射方法研究”(项目编号：11R