河北省马铃薯S 病毒株系的分子鉴定研究.pdfVIP

维普资讯 ● C T - iiORICULTURAE 华 北农 学报 ·2007，22(3)：3942 BOREllLI-SIHICl 河北省马铃薯 S病毒株系的分子鉴定研究 周巧梅 ，谢晓亮 ，温春秀 ，马 恢 ，尹 江 ，吴志明 (1．河北省农林科学院经济作物研究所，河北 石家庄 050051；2．河北省高寒作物研究所，河北 张家lYl 076450) 摘要：对张家 口分离的马铃薯 s病毒(PotatovirusS，PVS．Hebei)的 cP基因进行了克隆和序列分析。以提纯的马 铃薯植物总 RNA为模板 ，应用 RT-PCR技术扩增 目的基 因，PCR扩增产物克隆到质粒 pMD18一T上 ，并进行 了序列分析。 结果表明，克隆的cDNA片段 由885个核苷酸组成，编码 294个氨基酸组成的33kD蛋 白，与PVS外壳蛋 白的大小一 致，与国际基因库登记的几个株系相 比，结果表明，PVS—Hebei与它们之间的核苷酸序列同源性为82．4％～95．6％，氨 基酸序列的同源性为 93．9％～98．0％，进化树分析表 明，PVS明显存在 2个组 (组 I和组 Ⅱ)，PVS—Hebei归类为 I组， 与来 自组 I的欧洲普通株系 (PVS—Uk)的亲缘性要 比来 自组 Ⅱ北美的Andean株系 (PVS—A)株系的亲缘性要近 。 关键词：马铃薯 s病毒 ；外壳蛋 白基 因(CP)；序列分析 ；株系鉴定 中图分类号 ：$436．32 文献标识码 ：A 文章编号 ：1000—7091(2007)03—0039—04 M olecularIdentiffcationofPD virusSHebeiIsolate ZHOUQiao—mei，XIEXiao—liang，WENChun—xiu， MA Hui，YIN Jiang2，WU Zhi—ming (1．InstituteofEconomicCropResearch，HebeiAcademyofAgricultureandForestrySciences，Shijiazhuang 050051， China；2．ZhangjiakouHigh—landandColdCropResearchInstitute，Zhangjiakou 076450，China) Abstract：A isolateofpotatovirusS (PVS—Hebei)wasobtainedfrom potatoplantscultivatedinZhan~iakouof Hebeiprovinceandthecoatprotein(CP)genewascolnedandsequenced．TheCPgenewasamplifiedfromtotalextract- edpotatoRNAbyreveresetranscription—polymerasechainreaction(RT-PCR)．ThespecificPCRfragmentthenclonedin- tothepMD18-Tvectorandsequenced．Theresultshowedthattheclonedsegmentwas714bpandencodes294amino acidresidueswithrelativemolecularweightof33kD which isthelengthofthePVS CP，Comparisonofthenucleotide sequencebetweenthe CP geneandthoseofseveralPVSisolatesshowedthatthehomologyofare82．4％ 一95．6％ ，nad thehomoloyg oftheputativeaminoacidsequenceare93．9％ 一98．0％ respectively．Th eevolutionary distancesanalysis suggestedthatPVSisolateswasdividedintotwog