基于基因本体论的模式生物分子功能分布异同.pdfVIP

第8卷第3期 生物信息学 V01．8No．3 201 0年9月 ChinaJournalofBioinformatics Sep．，2010 基于基因本体论的模式生物分子功能分布异同 王巍1，卢卫红2，孙野青1’3，。 (1．哈尔滨丁业大学生命科学与工程系。哈尔滨150001； 2．哈尔滨工业大学食品科学与工程学院，哈尔滨150001； 3．大连海事大学环境系统生物学研究所。大连116026) 摘要：基因本体论是关于基因和蛋白质知识的标准词汇，也是今后实现各种与基因相关的数据统一、数据转换、数据挖掘的基 础。本文通过分子功能基因本体论比较了不同模式生物基因产物分子功能分布的异同。结果发现：在动物类、植物类以及真 菌类模式生物中，大部分已知功能基因的分布比例是基本一致的，存在一定的同源性；但在动物中结合类基因数量较多而在 植物与真菌中反而催化类基因数量较多，信号传导相关基因在动物中的分布数量多间接证明了动物在进化上的高等性，而植 物中特有的大分子传递相关编码基因，可能与植物的养分、水分在机体种的传输相关。 关键词：模式生物；基因本体论；分子功能 中图分类号：Q343文献标识码：A 文章编号：1672—5565(2010)一03—228一06 of model molecularf：mctionsbetween Compariscn erganisms basedon analysis geneontology WANG Weil，LUWei—hon92，SUNYe-qing‘’3’+ and Institute (J．Department Technology，Harbin of印ScienceEngineering，Harbinof 150001，China；； Sc如,neeand Institute 2．Department矿FoodEngineering，HarbinofTechnology，Harbin150001，China； 3．Institute Maritime ofEnvironmentalS声‘∞∞B如logy，DalianUmvers酊，Dalian116026，醌打m) Abstract：711leGene isa bioinformatiesinitiativeto the of and attributesacrossall ontologymajor unifyrepresentationgene geneproduct aimoftheGene ale andfurther itscontrolled of and ontology vocabulary species．the projectmaintaining developing gene geneproduct based att