生物信息学中数据库技术的应用.pdfVIP

总第 235 期 计算机与数字工程 Vol . 37 No . 5 2009 年第 5 期 Comp ut er Digit al Engineering 　　157 生物信息学中数据库技术的应用 刘智珺 (武汉生物工程学院　武汉 　4304 15) 摘 　要 　生物信息学是以计算机为工具对生物信息进行存储 、检索和分析的科学 。综述分析了在生物信息学中几种重 要的数据库及其应用 ,并对现状进行了分析与展望 。 关键词 　数据库技术 　生物信息学 　生物信息 中图分类号 　TP3 11. 13 Ap p licat i on of D at ab ase Tec h n ol ogy i n Bi oi nf or m at ics L iu Zhij u n ( Wu h a n Bi oen gin eerin g I nst it ut e , Wuh an 　4304 15) Ab s t r ac t 　B i oinf or m at ics is a b ody of scie nce t h at solves bi ol ogical p r oble ms using m et h odol ogy f r om c omp ut er sci 　　 e nce . Su m m ar y A n alysis s om e i mp or t a nt dat ab ases a n d t h eir ap p licat i ons in t h e r ese ar c h of Bi oinf or m at ics , a n d a n alysis t h e f or ecast t o t h e p r ese nt sit uat i on . Ke y w or ds 　dat ab ase t ec h n ol ogy , bi oinf or m at ics , bi ol ogic inf or m at i on Cl a s s N u m b er 　TP3 11. 13 DN A 序列方面 ,与其同步的还有蛋白质的一级结 1 　引言 构 ,即氨基酸序列的增长 , 已有一万多种蛋白质的 生物信息学是建立在数学 、计算机科学和生命 空间结构以不同的分辨率被测定 。基于 cDN A 序 科学基础之上的一门交叉学科 ,它主要研究如何获 列测序所建立起来的 EST 数据库其纪录已达数百 取 、分析 、处理 、存储和利用生物信息 。为了高效处 万条 。在这些数据基础上派生 、整理出来的数据库 理日益增长的海量生物数据 ,使全世界的研究人员 已达 1000 余个 。这一切构成了一个生物学数据的 能共享已有的研究成果 ,数据库技术在生物数据的 海洋 。这种科学数据的急速和海量积累 ,数据并不 处理和储存上有越来越重要的应用 。进入到 2 1 世 等于信息和知识 ,但却是信息和知识的源泉 ,关键 纪以来 ,人类已经进入了信息化的社会 。作为信息