拟南芥叶片和角果特异性启动子的筛选与分析.pdfVIP

中国油料作物学报 ２０１５，３７（１）：００１－００８ ＣｈｉｎｅｓｅＪｏｕｒｎａｌｏｆＯｉｌＣｒｏｐＳｃｉｅｎｃｅｓ ｄｏｉ：１０．７５０５／ｊ．ｉｓｓｎ．１００７－９０８４．２０１５．０１．００１ 拟南芥叶片和角果特异性启动子的筛选与分析 １，２ ２ １，２ ２ １ 郭　燕 ，詹高淼 ，杨晓燕 ，华　玮 ，吕应堂 （１．武汉大学，湖北 武汉，４３００７２；２．中国农业科学院油料作物研究所，湖北 武汉，４３００６２） 　　摘要：通过生物信息学方法和Ｇｅｎｅｖｅｓｔｉｇａｔｏｒ程序，从拟南芥基因组中筛选了１个叶片特异性表达基因ＡＣＤ６ （ａｔ４ｇ１４４００）和２个角果特异性表达基因ＡＴ２ＦＰ２（ａｔ５ｇ５７５２０）、ａｔ１ｇ５６１００，并通过实时定量ＰＣＲ分析它们在拟南芥 不同组织中的表达模式。从ＴＡＩＲ网站获得各基因的上游序列，利用ＰｌａｎｔＣＡＲＥ和ＢｉｏＰｒｏｓｐｅｃｔｏｒ预测各基因的启 动子序列，命名为Ｐａｔ４ｇ１４４００、Ｐａｔ５ｇ５７５２０和Ｐａｔ１ｇ５６１００。构建启动子驱动报告基因ｇｕｓ的植物表达载体，转化拟南 芥。转基因拟南芥 ＧＵＳ染色后发现：ＡＣＤ６主要在叶片中表达，Ｐａｔ４ｇ１４４００为叶片特异性启动子；ＡＴ２ＦＰ２和 ａｔ１ｇ５６１００在角果中的表达量比其他组织高数倍，Ｐａｔ１ｇ５６１００和Ｐａｔ５ｇ５７５２０具有角果特异性。 关键词：拟南芥；叶片；角果；生物信息学；特异性启动子 中图分类号：Ｓ５６５．４０３　　文献标识码：Ａ　　文章编号：１００７－９０８４（２０１５）０１－０００１－０８ ＬｅａｆａｎｄｓｉｌｉｑｕｅｓｐｅｃｉｆｉｃｐｒｏｍｏｔｅｒｓｏｆＡｒａｂｉｄｏｐｓｉｓｔｈａｌｉａｎａ １，２ ２ １，２ ２ １ ＧＵＯＹａｎ ，ＺＨＡＮＧａｏ－ｍｉａｏ，ＹＡＮＧＸｉａｏ－ｙａｎ ，ＨＵＡｗｅｉ，ＬＶＹｉｎｇ－ｔａｎｇ （１．ＷｕｈａｎＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｗｕｈａｎ４３００７２，Ｃｈｉｎａ； ２．ＯｉｌＣｒｏｐｓＲｅｓｅａｒｃｈＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙｏｆＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ，Ｗｕｈａｎ４３００６２，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ａｌｅａｆ－ｓｐｅｃｉｆｉｃｅｘｐｒｅｓｓｅｄｇｅｎｅＡＣＤ６ａｎｄ２ｓｉｌｉｑｕｅ－ｓｐｅｃｉｆｉｃｅｘｐｒｅｓｓｅｄｇｅｎｅｓ（ＡＴ２ＦＰ２， ａｔ１ｇ５６１００）ｏｆＡｒａｂｉｄｏｐｓｉｓｔｈａｌｉａｎａｗｅｒｅｏｂｔａｉｎｅｄｆｒｏｍＧｅｎｅｖｅｓｔｉｇａｔｏｒｂｙｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｓｅａｒｃｈ．Ｇｅｎｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｐａｔｔｅｒｎｓｗｅｒｅｄｅｔｅｃｔｅｄｅｍｐｌｏｙｉｎｇｒｅａｌ－ｔｉｍｅｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅＰＣＲ．Ｔｈｅｕｐｓｔｒｅａｍｒｅｇｉｏｎｓｏｆｔｈｅｓｅｇｅｎｅｓｗｅｒｅｏｂｔａｉｎｅｄ ｆｒｏｍＴＡＩＲｗｅｂｓｉｔｅ，ａｎｄｐｒｏｍｏｔｅｒｓｅｑｕｅｎｃｅｓｗｅｒｅｐｒｅｄｉｃｔｅｄｂｙｏｎｌｉｎｅｓｏｆｔｗａｒｅＰｌａｎｔＣＡＲＥａｎｄＢｉｏＰｒｏｓｐｅｃｔｏｒ．Ｔｈｅ ｐｒｏｍｏｔｅｒｓｗｅｒｅｎａｍｅｄａｓＰａｔ４ｇ１４４００，Ｐａｔ５ｇ５７５２０ａｎｄＰａｔ１ｇ５６１００ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ．ＩｎｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇｔｒａｎｓｇｅｎｉｃＡ． ｔｈａｌｉａｎａｐｌａｎｔｓ，ｈｉｓｔｏｃｈｅｍｉｃａｌＧＵＳｓｔａｉｎｉｎｇｓｈｏｗｅｄｔｈａｔＡＣＤ６ｗａｓｍａｉｎｌｙｅｘｐｒｅｓｓｅｄｉｎｌｅａｆ，Ｐａｔ４ｇ１４４００ｗａｓｌｅａｆ －ｓｐｅｃｉｆｉｃ．ＡＴ２ＦＰ２ａｎｄａｔ１ｇ５６１００ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｉｎｓｉｌｉｑｕｅｗｅｒｅｂｏｔｈｓｅｖｅｒａｌｔｉｍｅｓｈｉｇｈｅｒｔｈａｎｉｎｏｔｈｅｒｔｉｓｓｕｅｓ．Ｉｔ ｃｏｕｌｄｂｅｃｏｎｃｌｕｄｅｄｔｈａｔＰａｔ５ｇ５７５２０ａｎｄＰａｔ１ｇ５６１００ｗｅｒｅｓｉｌｉｑｕｅ－ｓｐｅｃｉｆ