新型标记SRAP及其在草业研究中的应用前景.pdfVIP

维普资讯 业与畜牧2o06年第7期总第12嘲 _U 缘 述 阜 宽0翰扈厕箭恳 陈 福 (重庆市畜牧科学研究院。重庆 400039) 摘 要：相关序列扩增多态性 (Sequence-relatedAmplifiedPolymorphism，SRAP)是最近发展起来的新型分子标 记，具有简便、可靠、易于测序等优点。SRAP独特的引物设计使其可检测基因的可阅读框 (0RF8I)区域，正、反向 引物分别与外显子和内含子 (或启动子)区域配对，因不同物种、不同个体的内含子、启动子与间隔区长度不等而产 生多态性，目前已开发出多个SRAP正、反向引物；SRAP-PCR扩增程序采用复性变温法，即前5个循环复性温度为 35％，后35个循环为50℃；目前SRAP已在植物图谱构建、遗传多样性评价、QrIL定位以及杂种优势预测等方面成功 应用。在草业研究方面，已有将SRAP标记用于野牛草种质资源遗传多样性分析的报道，其在草业研究中的应用前景 十分广问。 关键词：SRAP；分子标记；草业 中图分类号：Q75 文献标识码：A 文章编号：1006—1932(200l6)07—0001—04 当代分子生物学研究的一个重要领域是基因组 在多种植物中试验过 ，并成功应用于植物遗传图谱 分析，但是它的进展很大程度上取决于DNA分子标 构建、遗传多样性评价、基因定位、杂种优势预测 记技术的进步和发展。自从Botstein等【于 1980年利 以及比较基因组学等方面。目前不少实验室正在开 用RFLP构建人类遗传连锁图谱奠定了分子标记技 展这方面的工作，其应用前景是十分广阔的。 术研究的基础以来 ，动、植物的分子标记技术及应 1 SRAP的基本原理 用研究取得了令人瞩 目的进展。目前 ，已经建立并 SRAP与其他基于PCR的分子标记相比，独特之 在实际研究中得到应用的DNA分子标记技术已有 l0 处就在于它的引物设计。SRAP引物是针对基因组成的 多种，其中相关序列扩增多态性 (Sequence—related — 些特点而设计，I~P#F显子一般位于富含GC区域，在 AmplifiedPolymorphism，SRAP)是一种基于PCR的 不同个体中通常是保守的，而内含子、启动子则处于 新型标记 ，由美国加州大学蔬菜作物系u和 Quires 富含AT区域，在不同物种甚至不同个体间变异很大。 于 2001年在研究芸薹属作物中开发的 。它独特的 因此正向引物针对序列相对保守的外显子 ，使用 引物设计使其可检测基因的可阅读框 (OpenReading “CCGG”序列就可以特异扩增出含这些组分的序列； Frames，ORFs)区域 ，从而有别于 RAPD、AFLP、 反向引物针对变异大的内含子、启动子和间隔序列， ISSR等其他无须任何序列信息即可直接 PCR扩增的 使用 A“ATT”序列以特异结合富含 AT区。因此，该 分子标记 。SRAP自诞生以来 ，便以其操作简便快 标记通过独特的引物设计优先扩增基因组内的开放阅 速、成本低、可信度高、易于测序等特点倍受分子 读框 (ORFs)。正、反向引物分别与外显子和启动子 生物学家的青睐。在短短的几年时间内，此标记已 (或内含子)区域配对，因不同物种、不同个体的内含 子、启动子与间隔区长度不等而产生多态性。 收稿 日期：2006—01--04 SRAP-PCR反应体系中正向引物长 l7bp，由核 作者简介：陈福 (1965一 )，男，重庆大足人 ，畜牧师，主 心序列 CoreSequence)和3个选择性碱基组成，其 要从事牧草种质资源研究。 中核心序列长 l4个 bp，由5。端前