盐芥查尔酮合成酶基因的生物信息学预测与分析.pdfVIP

现代农业科技2010年第24期 农业基础科学 盐芥查尔酮合成酶基因的生物信息学预测与分析 高亚平李玮刘艳 (山东师范大学生命科学学院．山东济南250014) GCFAGGTvLR)。 关键词盐齐；查尔酮合成酶；生物信息学；预测 文献标识码A 中图分类号Q811．4 文章编号1007-5739(2010)24-0031-01 BioinformaticsPredictionand ofChaconne Geneof Analysis Synthesis TbeUungiellaSalsuginea GAO LIⅥreiLIUYan Ya—ping ofLife Normal 250014) (Collegescience，ShandongUniversity，ShandongJinan Abstract111echaractersofChalcone such0．8 the ofamino synthageprotein compositionacid。equipotential，active based of sites．secondstructurewere OntheProtParalll，GOR4，ProtSiteandNetPhossoftware．Results：theoreticalthis phosphorylation analyzed pl wag theformuhWaS containedachalcone activesitefrom184t0 8．55，and C1丁小狮N∞05l甄．，rIIisprotein synthase protein GCFAGGTvLR)． words Key Thellungiellasalsuginea；Chalconesynthasegene；Bioinformatics；predictidn 查尔酮合成酶(Chalconesynthase。CHS，EC2．3．1．74)广 泛分布在植物界中。是植物次生代谢途径中的关键酶。查尔 酮合成酶是所有黄酮类化合物合成的关键酶。它参与了此 类物质合成的第一步，它的作用是催化香豆酰辅酶A和丙 二酰辅酶A生成苯基苯乙烯酮fl】。该物质具有很多重要的功 盐芥 能，如参与花色的形成、花粉育性、UV防护、抗病性和根瘤 形成等等。盐芥作为一种具有多重耐受性的植物，是继拟南 芥之后的又一种具有研究价值的模式植物。该文利用生物 信息学的方法搜索盐芥CHS基因的相关片段。以期为该基 因的深入研究提供有价值的理论依据。 1材料与方法 for lnfor— 数据资料来源于NationalCenter Biotechnology 图2 TreeView对盐芥Clis基因的同源关系分析 mation(NCBI)EST数据库中已注册的盐芥的核酸序列。用 个物种中该基因进行了同源性分析，结果如图2所示。 Blast对其亲缘关系予以描述；用ProtParam阁分析该基因编 2．2盐芥查尔酮合成酶基因编码蛋白的理化性