侵染小苹果的苹果锈果类病毒的检测和全序列分析.pdfVIP

艋物保 2015，41(1)：126—128 PlantProtection 侵染小苹果的苹果锈果类病毒的 检测和全序列分析 郝 璐， 叶 婷， 王少杰， 国立耘， 范在丰， 周 涛 (中国农业大学植物病理学系 ，北京 100193) 摘要 小苹果是抗寒海棠类与大苹果的杂交后代，因耐寒能力强，1：7感好，被广泛用于嫁接与育种材料，是我国寒凉 苹果产区宝贵的种质资源。苹果锈果类病毒(Applescarskinviroid，AssVd)侵染苹果后引起果实表面产生锈状 斑、花脸、畸形等症状，严重降低果实品质和市场价值 。2013年在调查苹果病毒病时发现北京市延庆县种植的小苹 果表现出典型畸形症状，应用RT-PCR方法对其进行检测后经测序和序列分析表明，小苹果被苹果锈果类病毒侵 染。克隆此分离物(ASSVd-YQ)全基因组序列，分析后得到其基因组全长为329个核苷酸，系统发育分析表明该分 离物与来 自不同国家和地区的ASSVd分离物间的进化关系极近。二级结构预测表明，该分离物的中央保守区与 末端保守区与ASSVd参考序列相 同。这是对侵染小苹果的ASSVd的首次检测和鉴定。 关键词 苹果锈果类病毒； 小苹果； 分子检测；序列分析 中图分类号： S432．1 文献标识码： A DOI： 10．3969／j．issn．0529—1542．2015．01．024 DetectionandfullsequenceanalysisofApplescarskinviroid in smallapples HaoLu， YeTing，WangShaojie， GuoLiyun，FanZaifeng， ZhouTao (DepartmentofPlantPathology，ChinaAgriculturalUniversity，Beijing 100193，China) Abstract Smallapplesarehybridgenerationsofcold-resistantcrabapplecultivarsandbigapples．Becauseoftheir strongenduranceundercoldandgoodtaste，smallapplesarewidelyusedasgraftingandbreedingmaterials，and arepreciousgermplasm resourcesincoldregionsinourcountry．Applesearskinviroid(ASSVd)causesserious damageonapplefruitsandhugeeconomicloss．Duringasurveyofapplevirusdiseasein2013，somesmallapples withtypicalmalformationsymptomswerefoundinYanqingCounty，Beijing．RT-PCRandsequencingshowed thatthosesmallappleswereinfectedbyASSVd．Thefullnucleotidesequenceofthisisolate(ASSVd-YQ)compri— ses329nucleotides．Phylogeneticanalysisshowedthisisolatehadcloseevolutionrelationshipwithotherisolates reportedindifferentcountriesandregions．Secondarystructurepredictionshowedthatthecentralconservedre- gion(CCR)andterminalconservedregion(TCR)wereidenticaltothereportedASSVdreferencesequence．This isthefirstisolationandidentificationofASSVdinsmallapples．