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最短距离聚类的matlab实现
说明:正文中命令部分可以直接在Matlab中运行,作者(Yangfd09)在
MATLAB R2009a(7.8.0.347)中运行通过
%最短距离聚类
%说明:此程序的优点在于每一步都是自己编写的,很少用matlab现成的指令,
%所以更适合于初学者,有助于理解各种标准化方法和距离计算方法。
%程序包含了极差标准化(两种方法)、中心化、标准差标准化、总和标准化和极大值标准化等标准化方法,
%以及绝对值距离、欧氏距离、明科夫斯基距离和切比雪夫距离等距离计算方法。
%==========================导入数据==============================
%变量存放在data.mat中,变量名为test
%数据要求:m行n列,m为要素个数,n为区域个数
load data.mat
testdata=test;
%============================标准化===============================
%变量初始化,m用来寻找每行的最大值,n找最小值,s记录每行数据的和
[M,N]=size(testdata);m=zeros(1,M);n=9999*ones(1,M);s=zeros(1,M);eq=zeros(1,M);
%为m、n和s赋值
for i=1:M
for j=1:N
if testdata(i,j)=m(i)
m(i)=testdata(i,j);
end
if testdata(i,j)=n(i)
n(i)=testdata(i,j);
end
s(i)=s(i)+testdata(i,j);
end
eq(i)=s(i)/N;
end
%sigma0是离差平方和,sigma是标准差
sigma0=zeros(M);
for i=1:M
for j=1:N
sigma0(i)=sigma0(i)+(testdata(i,j)-eq(i))^2;
end
end
sigma=sqrt(sigma0/N);
jicha=m-n;
%极差标准化(两种方法)、中心化、标准差标准化、总和标准化和极大值标准化。
he=sum(testdata,2);
testdata_jc0=zeros(M,N);
testdata_jc1=zeros(M,N);
testdata_zx=zeros(M,N);
testdata_std=zeros(M,N);
testdata_zonghe=zeros(M,N);
testdata_jdzh=zeros(M,N);
for i=1:M
for j=1:N
testdata_jc1(i,j)=(testdata(i,j)-n(i))/jicha(i);
testdata_jc0(i,j)=testdata(i,j)/jicha(i);
testdata_zx(i,j)=testdata(i,j)-s(i)/N;
testdata_std(i,j)=(testdata(i,j)-eq(i))/sigma(i);
testdata_zonghe(i,j)=testdata(i,j)./he(i);
testdata_jdzh(i,j)=testdata(i,j)/m(i);
end
end
%=================选择标准化方式,计算距离=========================
test=testdata_jc1; %把此处修改为你需要的标准化方式,注意不要删掉转置符号“ ’ ”
% testdata_jc1:极差标准化,分子减去最小值;testdata_jc0:极差标准化,不减最小值
% testdata_zx:中心标准化;testdata_std:标准化擦标准化;
% testdata_zonghe:总和标准化;testdata_jdzh:极大值标准化。
[M,N]=size(test);
a=?;
d_abs=zeros(M,M);d_ou0=zeros(M,M);
d_qie=zeros(M,M);d_qie0=zeros(1,N);
%===如果需要计算明科夫斯基距离,把对应程序行前面的“%”删去即可
%if(1)
% a=input(计算明可夫斯基距离?(Y/N),s);
% if(a==Y||a==y)
% d_ming0=zeros
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