Reconstruction of Pathways Associated with Amino Acid Metabolism in Human Mitochondria.pdfVIP

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2017-08-10 发布于河北
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Reconstruction of Pathways Associated with Amino Acid Metabolism in Human Mitochondria.pdf

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维普资讯 Article ReconstructionofPathwaysAssociatedwithAm inoAcidM etabolism in Human M itochondria PurnimaGuda ．ChittibabuGuda ．andShankarSubramaniam。，。 1Gen*NY*sisCenterIorExcellenceinCancerGenomicsandDepartmentofEpidemiologyandBiostatistics． StateUniversityofNewY0 atAlbany，Rensselaer,NYl2144—3456,USA；2SanDiegoSupercomputerCenter, UniversityofCaliforniaatSanDiegoILaJolla}CA 92093-0505,USA；3DepartmentsofBioengineering, ChemistryandBiochemistry，UniversityofCaliforniaatSanDiego，LaJolla，CA92093,USA． l7V_ehave used a bioinform aticsapproach fortheidentification and reconstruction ofm etabolicpathwaysassociatedwitham inoacidm etabolism inhum anm itochon． dria． Hum an m itochondrialproteins determ ined by experimentaland computa- tionalm ethodshavebeen superposedon thereferencepathwaysfrom theKEGG databasetoidentifymitochondrialpathways．Enzymesattheentryandexitpoints ofreach reconstructed pathway were identified，and mitochondrialsolute carrier proteinswere determ ined where applicable． Interm edlate enzym es in the m ito． chondrialpathwayswere identified basedon theannotationsavailablerfom public databases，evidencein currentliterature，orourM IToPRED program ，which pre． dictsthe m itochondriallocalization ofproteins．Through integration ofthedata derived rfom experim ental，bibliographical，and computationalsources，we recon． structed theam inoacid m etabolicpathwaysin human m itochondria，which could help betterunderstandthem itochondrialm etabolism and itsrolein humanhealth． Key words：m itochondria，metabolicpathways，am inoacid m etabolism ，human Introduction Reconstruction ofthe metabolic mapsoffully se- potentialvaluetobiomedicalresearch areassuch as quenced