植物炭疽菌分子鉴定和分类的研究进展.pdfVIP

种植业科学与技术 植物炭疽菌分子鉴定和分类的研究进展 江 晶，江 彤，檀根甲 (安徽农业大学植物保护学院，合肥230036) 摘要：近年来，分子生物学研究取得了很大进展，现从ITS (RAPD)以及扩增片段长度多态性(AFLP)等分子标记技术，对植物炭疽菌分子鉴定以及分类工作中的应用情况进行综述。 关键词：炭疽病；分子鉴定；研究进展 炭疽病是普遍存在的植物病害。引起炭疽病的病 1994年，Sherrif等p4通过rDNA序列分析鉴定出炭 原菌为炭疽菌属(Colletotrichum)真菌，炭疽菌的寄主 范围非常广泛，可在多种植物体上繁衍生长。胶孢炭疽 FGG型(快速生长型)柑桔炭疽菌鉴别为胶胞炭疽菌。 菌(egloeosporioides)是炭疽菌属内最大的1个种，其 分布非常广泛，可以引起许多植物的炭疽病，危害寄主 疽病的分离物鉴别为胶胞炭疽菌，都与形态学鉴别结论 种类繁多，达1000多种¨J。传统的炭疽属分类，是以 形态学以及寄主范围分类为主。种的分类主要以分生 孢子形态、附着胞形态、刚毛的有无、菌落培养特征等作 学不符合的结果，说明该炭疽菌可能存在着种的变异现 为分类依据…。由于炭疽菌种间形态特征差异微小和 不稳定，该属的分类一直较为混乱，特别是种下分类更 扩增，能将胶胞炭疽菌与其他炭疽菌种类区别开来，其 是十分困难。相对于形态学分类，分子分类能够反映物 MORIWAKI 鉴定结果与形态鉴别的相吻合。Jouji 种间核苷酸序列最本质的差异，分类性状稳定而标 等¨刨以ITS序列相似性为依据，结合形态学对日本炭 准b]。近年来，分子技术在炭疽菌种问及种内鉴定和 分类上取得了巨大进展，如测定炭疽菌ITSrDNA序列 差异、RAPD法、PCR—RFLP法、AFLP法、基因组DNA的 AT富集区分析法等。 引物，对不同来源的草莓炭疽菌的系统关系进行了 1 ITS rDNA序列差异分析 真菌在进化过程中，其核糖体脱氧核糖核酸(rD． 疽菌属24个种的ITS区域，设计2对特异性引物，可将 NA)序列较为保守，但其基因序列中存在着可变区和 高变区，这些相对变异较大区域往往能够反映出真菌种 间和种内的差异。真菌基因组中编码核糖体的基因包 等【141通过克隆测序香蕉炭疽菌的ITS全序列并与Gen． 括3种，28SrDNA、18SrDNA和5．8SrDNA。它们在染Bank中炭疽菌属其他种的ITS序列比对，设计出香蕉 色体上头尾相连、串联排列，相互之间分别由不同的间 隔区分隔开。这种位于rDNA大小亚基18S和28S基以从香蕉炭疽菌株中扩增出382bp的特异性片段，而其 因之间的间隔区域片段称为内转录间隔区ITS(internal余20个参试菌株和香蕉组织的PCR反应结果为阴性。 transcribed spacers，ITS)，一般而言，ITS在真核生物种 2随机扩增多态性DNA(RAPD)分析 间和亚种间变化较大，可通过PCR扩增ITS区并测序 RAPD(Random DNA)分子标 来揭示种间或种内群体间的差异，从而进行植物病原真 AmplifiedPolymorphic J。利用rDNA区的ITS序列设 菌种的快速分子鉴定H 记技术是以基因组DNA为模板，以随机的寡核苷酸序 计种特异性引物进行PCR扩增在炭疽菌种的鉴定中已 列(通常lo个碱基对)作引物，通过PCR扩增反应，产 有很多应用。 生不连续的DNA产物，用于检测DNA序列的多态性。 100 现代农业理