嗜水气单胞菌气溶素和溶血素基因的克隆与结构预测.pdfVIP

江西农业大学学报 　20 10 , 32 (2) : 0356 - 0362 h ttp : / / xuebao. jxau. edu. cn A cta A gricu ltu rae U n iversitatis J iangxien sis E - m ail: ndxb7775@ sina. com 嗜水气单胞菌气溶素和溶血素基因的 克隆与结构预测 1, 2 1 1 1 1 1 刘明智 ,叶　星 , 田园园 ,邓国成 ,马冬梅 , 白俊杰 ( 1. 中国水产科学研究院 珠江水产研究所 ,广东 广州 510380; 2. 上海海洋大学 ,上海 20 1306) 摘要 :从患出血病草鱼体上分离出 1个菌株 ,传统分类学及 16S rRNA 基因鉴定其为嗜水气单胞菌 ,人工感染实 ( ) ( ) 验显示该分离菌株为强毒株 。克隆该菌株的气溶素 aero lysin, aerA 基因和溶血素 hemo lysin, h lyA 基因 ,序列 分析显示这 2个基因只有 46. 7%的同源性 。B last分析显示 , h lyA 基因与 GenB ank上已登录的 h lyA 序列具有较 高的同源性 ,而 aerA 基因与已登录的 aerA 基因以及一些 h lyA 序列也具有较高的同源性 。对与 aerA 基因同源 性较高的这些 h lyA 序列进行结构域预测 ,发现它们均具有 A PT结构域和气溶素结构域 ,说明它们实际上应是 aerA 基因 ,只是命名上与 h lyA 基因混淆 。用 DNA star软件预测 aerA 和 h lyA 的抗原区 ,显示它们均具有很好的 抗原性 。用特异性引物检测菌株的 aerA 基因和 h lyA 基因 ,结果显示 2 株毒力株均有特异条带 ,而无毒株则未 扩增到特异条带 ,说明 aerA 和 h lyA 有可能作为鉴定嗜水气单胞菌毒力菌株的标记 。 关键词 :嗜水气单胞菌 ;气溶素 ;溶血素 ;基因;序列 中图分类号 : S94 1. 42　　文献标识码 : A 　　文章编号 : 1000 - 2286 (2010) 02 - 0356 - 07 Clon ing and Structure Pred iction of aerA Gene and h lyA Gene of A erom on as hydroph ila 1, 2 1 1 L IU M ingzh i , YE X ing , TIAN Yuanyuan , 1 1 1 D EN G Guocheng ,MA Dongm ei , BA I Junj ie ( 　　 1. Pearl R iver F isherie s R e search In stitu te, Ch ine se