09QTL精细定位策略及水稻产量相关性状QTL分析.pdfVIP

维普资讯 专论与综述 中固稻米 2008年第3期 QTL精细定位策略及水稻产量相关性状QTL分析 余守武 杨长登 李西明 (中国水稻研究所 水稻生物学国家重点实验室，浙江 杭州 310006) 摘 要：随着分子标记技术及水稻基因组学的发展，水稻产量相关性状 QTL研究已进入 QTL精细定位及克隆阶 段。阐明控制复杂性状QTL的分子遗传基础，对于其在分子育种中的应用具有重要意义。本文针对 目前构建QTL精 细定位群体的主要策略及水稻产量相关性状 QTL分析进展进行了综述。 ， 关键词：水稻；QTL；精细定位；产量性状 水稻是世界上最重要的粮食作物之一，约有一半 但表型鉴定以单株为基础，准确性不高；每一个体的后 人口以稻米为主食，占世界人口60％的亚洲 ，其水稻种 代都可以发生分离 ，不能重复试验。回交群体内每一个 植面积超过世界的90％t”。至2050年，世界人口将增至 体的基因型都是杂合的，而只能估计显性效应。永久性 89亿2【1，而预计至 2030年 ，粮食产量需在 目前基础上 分离群体包括重组 自交系群体(RIL)和加倍单倍体群 增加40％才能满足人 口不断增加的粮食需求I“。我国稻 体(DH)等，前者构建时间长，但后代稳定，不发生分 作面积与稻谷总产量分别 占全世界的23％和 37％，为 离，后者因在花培过程中可能受基因型选择的影响，构 世界上最大的稻米生产国和消费国。虽然 目前水稻总 建难度大。两者都只能估计加性效应，不能估计显性效 产保持在较高水平，但单产水平一直徘徊不前。随着社 应。 会现代工业化进程的加快及环境污染的 日益严重 ，提 1．2 QTLs精细定位及主要策略 高水稻单产潜力的难度越来越大，而水稻在粮食安全 初步定位到的QTL只说明染色体上的某个区域 问题上 占有举足轻重的地位。因此 ，提高水稻产量仍是 可能存在控制数量性状的基因，并不能明确基因的具 当前及今后水稻遗传育种学家的重要研究课题之。 体基因组位置，通常为 10～30eM3[1。一般地，每 lOOkb的 水稻诸多重要农艺经济性状如株高、抽穗期、产量 基因组 DNA包含有 10来个基因。因此，在水稻中，按 和品质等都属于由多基因控制的数量性状，其表型表 lcM约为 250kb估计，则在 10～30cM的基因组区域中 现为连续分布，且受环境及基因之间的影响，遗传基础 约包含几百个基因。然而，在初级定位中，利用大量的 比较复杂。虽数量性状基 因 (Quantitativetraitsloci， 分子标记和完善的统计分析软件，对置信区间的缩小 QTL)的克隆与质量性状主基因基本方法相似，而经典 并不是很有效。因此，需考虑对初步定位到的QTL进 遗传学难以把数量性状作为单个孟德尔因子来研究。 行精细定位 ，即在 QTL初定位基础上 ，针对 目标 区间 随着分子标记技术及基因组研究的突破性进展 ，实现 构建遗传背景一致的次级遗传分离群体，把复杂性状 了将复杂的数量性状分解为单个孟德尔因子 ，并将进 QTLs界定于更小的基因组区域。其基本程序是，首先， 一 步促进数量性状基因在育种中的应用。 应用原始亲本材料构建的遗传分离群体，构建覆盖基 因组大部分区域的连锁图谱，进行全基因组扫描，检测 1QTL定位群体及精细定位策略 控制 目标性状主要变异的QTL；然后，筛选在 目标QTL 1．1 QTL初级定位群体及特点