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名词解释
基因:基因是一段携带功能产物(多肽,蛋白质,tRNA和rRNA和某些小分子RNA)信息的DNA片段,是控制某种性状的的遗传单位。
基因诊断:指利用现代分子生物学和分子遗传学方法,通过检测基因的结构或表达功能的异常,对人体状态和疾病作出诊断的方法和过程
基因组(genome):指生物体的一套完整的单倍体遗传信息。
基因组学分类1. 根据研究的重点分类:结构基因组学,功能基因组学,比较基因组学
2. 根据研究对象分类:肿瘤基因组学、植物基因组学、药物基因组学、环境基因组学等
基因组学的主要研究内容
结构基因组学(structural genomics):通过基因作图、核苷酸序列分析确定基因组成、基因定位的科学。
功能基因组学(functional genomics):利用结构基因组学提供的信息,进行基因和非基因序列功能的研究。
比较基因组学(comparative genomics):比较不同生物间基因和基因组结构的差异,以增进对基因功能的了解、阐明物种进化关系
2、类核:原核生物基因组DNA位于细胞的中央区,与支架蛋白和RNA结合在一起,以复合体的形式存在,经高度盘旋聚集形成一个较为致密的区域,称为类核。
3、质粒:是细菌细胞染色体以外的能独立复制并能稳定遗传的共价闭合环状DNA分子。
1. 质粒的结构
通常有三种构型: 共价闭环DNA分子
半开环DNA分子
线性DNA分子
2.质粒的理化性质:具有核酸分子的一般理化特性
如可嵌入某些染料( EB,溴化乙锭 )
具有较强的抗切割和抗变性的能力
4、重叠基因(overlapping gene):病毒基因组的一段DNA序列有两个或两个以上的开放读码框架,可以编码两种或两种以上的多肽链,称为1.基因组大小相差很大2.核酸结构多样性:DNA 或 RNA,单链或双链,环状分子或线性分子3.基因组有连续的,有不连续的4. 编码序列90% 5. 基因有连续的和间断的 (有内含子) 6. 基因重叠7. 一些病毒基因组的末端具有特殊的序列结构:帽子和poly(A)尾;末端重复序列:正向、反向、LTR;粘性末端8. 多为单拷贝, 逆转录病毒除外
分段基因组是指病毒基因组由数条不同的核酸分子组成。
蛋白质与核酸间相互作用的目的在于:对基因表达进行调控。
蛋白质之间相互作用的形式:分子和亚基的聚合、蛋白分子杂交、分子识别、分子自我装配,多酶复合体
核酸分离提取的原则:1.保证核酸一级结构的完整性;2.尽量排除其他分子的污染,保证提取核酸的纯度;
重组DNA技术:是指在体外利用酶学方法将目的DNA片段与能自主复制的载体分子连接,形成重组DNA分子,然后将重组DNA导入宿主细胞中复制、扩增,从而获得单一DNA分子的大量拷贝。
限制性核酸内切酶(restriction endonuclease, RE):是识别DNA的特异序列, 并在识别位点或其周围切割双链DNA的一类内切酶。
5、载体(vector)DNA分子。DNA的纯度、反应系统、反应体积、保温时间与温度
克隆载体(cloning vector)为使插入的外源DNA序列被扩增而特意设计的载体称为克隆载体。
克隆载体应具备的主要特点:至少有一个复制起点;至少有一个选择性标志;有适宜的限制性内切酶的单一切点:称为多克隆位点;应有较高的拷贝数。
常用克隆载体:质粒;噬菌体;黏粒
重组DNA应用领域:基因诊断,基因治疗,基因工程药物,基因敲出和转基因技术
体外基因扩增技术常用策略:
靶基因扩增系统:聚合酶链反应(PCR)
转录依赖的扩增系统(TAS)
链替代扩增(SDA)
2.探针扩增系统:连接酶链反应(LCR) Qβ复制酶(QβR)体系
3.信号放大系统:分支DNA(bDNA)
杂交捕获系统
(一)PCR反应体系
1. 模板
单、双链DNA均可。
不能混有蛋白酶、核酸酶、DNA聚合酶抑制剂、DNA结合蛋白类。
DNA模板:质粒DNA 10ng;基因组1000ng。
模板浓度过高会导致反应的非特异性增加。
2. 引物
引物长度: 18-40 nt
碱基:G+C含量: 40-60%,碱基分布的随机性
引物自身:防止发夹样结构
引物之间:防止二聚体
引物的3’端:严格要求配对
引物的5’端:可被修饰
引物的特异性:
3. 耐热DNA聚合酶
4.脱氧核苷三磷酸(dNTP)
5. 缓冲液
PCR衍生技术:原位PCR;逆转录PCR;反向PCR;多重PCR ;标记PCR;巢式PCR;任意
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