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中国基础科学 ·研究进展
DNA 分子上的磷硫酰化 :一个新领域的诞生
◆邓子新
对 DNA 的研究是生命科学领域最引人注 目的 规 ”现象穷根问底的好奇心成了这项发现的最原始
研究内容之一 。早在 20 世纪 50 年代 ,科学界就已 的 “引子 ”。
确认 DNA 是生命的遗传物质 , 它由碳 、氢 、氧 、氮和 2. DNA 降解原因的排查
磷 5种元素构成 ; 1953 年 , DNA 分子双螺旋结构的 比照可能造成降解的一系列可能的物理 、化学
揭示开创了分子生物学新时代 。 和生物学原因 , 我们提 出了一系列质疑 。同样 的
在基本的 DNA 骨架之外 , DNA 修饰是另一个专 DNA 在试管中不降解而只在电泳过程中才降解是不
门领域 。1965年 ,细菌中 DNA 甲基化修饰的发现 , 是因为电泳过程提供了氧 ,或导致了缓冲液中未知
构成了对 DNA 结构的重要补充 。甲基化修饰可限 化合物的氧化 ? 导致 DNA 降解的这批电泳缓冲液是
制外来 DNA 的入侵 ,使生物遗传保持稳定性 , 它在 不是对热敏感 , 其化学成分与正常缓冲液相比有什
基因表达 、基因沉默等方面的作用对分子生物学的 么变化或不同? 是不是这批电泳缓冲液中污染了未
发展起到里程碑式的贡献 。这一发现开启了 DNA 知的金属离子 , 或者是污染了微生物进而产生了可
甲基化修饰新领域 , 并 由此诞生 了一个新 的学 降解 DNA 的某种酶 ? DNA 上是否结合了未知的蛋
科 ———表观遗传学 ,该发现并因此于 1978 年被授予 白质或抗生素 ? 是不是 DNA 上发生了已知的在生
诺贝尔生理学或医学奖 。 物界普遍存在的甲基化修饰 , 或者是一种尚未揭示
2007年 , 我们与美国、英国科学家合作在一种 的新的甲基化修饰 ? 我们通过综合利用物理 、化学
细菌的 DNA 骨架上发现了磷硫酰化修饰 ,其精细结 手段和微生物及其酶的分离纯化和检测技术对这些
构为 “R 构象的磷硫酰 ”,该发现构成了对 DNA 结构 基本物理 、化学和生物学现象和机理进行了反复和
修饰的又一全新补充 。 同步的比较 , 但都一一得出了否定的答案 。
该发现经历了一个从偶然的现象到揭示 DNA 3. 异常修饰的直接证据
磷硫酰化修饰的化学本质历时 20 年的艰苦的科学 我们开始考虑是否是在 DNA 上存在一种新的
探索过程 。 异常修饰 ,这需要提供令人信服的直接证据 ,其中之
1. DNA 降解现象的不同解读 一就是筛选到这种修饰的突变体 。但依靠当时仅知
我们在对一批细菌 DNA 进行电泳实验时 ,发现 的依赖于 DNA 降解表型的丧失来筛选 ,按正常突变
在同一块 电泳凝胶上 , 一些细菌的 DNA 发生了降 率来计算 , 可能需要对诱变后数以万计乃至 10 万计
解 ,而一种名为 “变铅青链霉菌 ”的细菌 DNA 却不降 的个体进行电泳 ;而且需要证明每个提取的总 DNA
解 。事实上 , DNA 分子的这种不稳定现象在众多生 样本并没有发生人工操作过程导致的理 、化降解 ,这
物学实验中经常遇到 。在很多文献中 , 这个现象被 需要事先在正常电泳缓冲液中对每个 DNA 样本预
普遍解读为因 DNA 提取过程中人为操作不当而不 电泳一次 , 这无疑意味着电泳次数的加倍 。
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