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生物芯片技术在新药筛选中的应用.pdf
山东医药2005 年第45 卷第26 期
系列诊断芯片已开始进入市场。 低度病变(CIN I) , 高危险型HPV 亦有多种, 与宫颈癌及宫颈上
1. 3 检测细菌毒素和毒力因子 葡萄球菌肠毒素( SES) 是 皮内高度病变(CIN Ê/ Ë) 的发生相关, 尤其是HPV 16 和 18
由 黄色葡萄球菌产生的, 可引起急性胃肠炎, 目前已知有 型。因此正确确定HPV 的型别对于寻找肿瘤的病因及肿瘤的预
17 种血清型包括SEA 到SER( 无SEF), 其编码基因ent 的基 防有重要意义。目前检测HPV 的寡核苷酸微阵列的试剂盒已经
因序列在各型之间比对发现也存在保守区和可变区, Sergeev 问世, 并有对其应用评价的相关报道。
等根据 基因制备微阵列, 可同时检测多种 基因型。 2. 4 检测流感病毒 流感病毒传染性较强, 流行的毒株常发
ent ent
大肠埃希菌是肠道的正常菌群, 通常不致病, 但在获得了 生称为漂移和转变的变异, 表面血凝素( HA) 及神经氨酸酶
毒力基因的决定簇后成为致病菌, 其毒力基因是研究确定大 ( )两种结构决定了流感病毒的亚型, 根据 、 的基因
NA HA NA
肠埃希菌致病性的理想的靶基因, Bekal 等建立了一种毒力 设计探针建立特异性寡核苷酸微阵列, 可用于检测流感病毒
因子微阵列技术, 将所有已知的91 个毒力基因( 包括不耐热 并进行分型。
毒素LT , 耐热毒素 ST, 志贺毒素Stx 1 和 Stx2, 7 种溶血素 3
Hly 、Ehx 、East 1、ST 、EspA 、EspB、EspC, 3 种细胞毒坏死因 鉴于生物芯片的平行性特点, 许多研究者尝试用其进行
子, 24 种黏附因子, 分泌系统 Etp, 荚膜抗原, 菌体抗原, 鞭毛 多种病毒的同时检测, 如Wang 等根据多种呼吸道病毒的基
抗原, 透明质酸酶等)进行扩增点在玻片上制备毒力基因微阵 因序列设计了长片段(70nt) 寡核苷酸探针微阵列, 用病毒感
列, 为毒力基因检测及菌株亚型的确定提供了强有力的技术 染的细胞培养物检测鉴定多种病毒, 包括呼吸道合胞病毒、副
手段。蛋白芯片的出现, 为在蛋白质水平平行检测毒素抗体或 流感病毒、腺病毒、人鼻病毒、Kaposi 肉瘤相关疱疹病毒, 并
抗原提供了方便条件, Rucker 等建立了同时检测多种毒素的 能区分病毒的亚型。
抗体微阵列, 包括霍乱毒素 亚单位、白喉毒素、炭疽致死因
B Du urcq 等建立了一种新的肽—蛋白微阵列同时检测
子和保护性抗原、 黄色葡萄球菌肠毒素B 及破伤风毒素 C HCV 、HBV 、HIV 、梅毒(Tp) 的病原体感染。我国丁亚平等人
片段, 其检测限度可与免疫夹心法相媲美。 建立了一种蛋白微阵列, 同时检测血清中HIV 、HCV 及Tp
2 抗体, 与ELISA 试剂盒, 具有高度的符合率。Perrin 等尝试将
2. 1 检测艾滋病病毒(HIV) 早在 1996 年Kozal 等人就开 寡核苷酸微阵列与蛋白微阵列结合, 同时检测 、 、
HBV HCV
始与 公司合作研制基因芯片, 对 - 1 亚型中
Affymetrix HIV B HIV 的DNA 和抗体, 取得了初步的结果。
的逆转录酶和蛋白酶基因的多态性进行了分析, 这也是基因 Bacarese-Hamilton 等制备了抗原微阵列, 可检测血清中
芯片第一次用于临床。1998 年K
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