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单核苷酸多态性与其在牛育种中的应用.pdf

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』…‘◆…。◆…I◆川l+…l+¨¨、 i综 述i l…{◆…I◆…l◆…I+…I◆…IJr 文章编号:1001—9111(2007)03一002Z—03 单核苷酸多态性及其在牛育种中的应用 万亚琴,左福元‘,谢和芳 (西南大学动物科技学院,重庆荣昌402460) 摘要:单核苷酸多态性(SNPs)被公认为是最新的第3代分子标记,它将成为理想分子标记 之一。本文介绍了SNP的概念、特点以及在牛生长发育性状、胴体和肉质性状、产奶性能、抗病 性状中的应用。 关键词:牛;单核苷酸多态性;育种 中图分类号:S823.2 文献标识码:A 在经典的遗传学理论出现以前人类早已开始了 家畜育种活动。在没有遗传学知识的情况下,育种者 一般只有2个等位基因,在检测时只需要通过一个 依靠的是”表型观察”的育种方式。随后,通过在染色 简单的“+/一方式即可进行基因分型,这使得检 体水平及DNA水平上开展的生物遗传研究的不断测、分析易于实现自动化[31;(3)遗传稳定性强,与微 深入,育种工作已经步入到分子水平。因此,寻找一 卫星等重复序列多态性标记相比,SNPS具有更高 些可靠的遗传标记来提高选择效率与效能是至关重 要的工作之一。随着人类基因组测序工作的完成,专 已知DNA多态性的80%以上,是最常见的遗传变 异类型。 家们预测,由美国麻省理工学院(MIT)的E.Lander nu— 于1996年提出的单核苷酸多态性(single 2 SNP在牛育种中的应用 cleotide polymorphism,SNP),将成为理想分子标 记之一[1|。 2.1生长发育性状 1 SNP的概念及特点 骼肌生长发育的抑制因子,牛的”双肌”性状就是由 单核苷酸多态性,主要是指由基因组核苷酸水 平上的变异引起的DNA序列多态性,包括单碱基 埃蒙特牛、皮荷杂种牛和荷斯坦牛的DNA为模板, 对牛的MSTN基因进行单核苷酸多态性分析,提出 的转换、颠换,以及单碱基的插入/缺失等。 了一套牛MSTN基因检测分析以及准确鉴定其基 第1代分子标记限制性片段长度多态性 (RFLP)主要研究对象是由限制性酶切位点的差异 方法对中国秦川牛、南阳牛以及国外引入品种皮埃 造成的DNA片段长度多态性;第2代分子标记是 蒙特牛双肌基因的第三外显子进行了多态性分析, 数目可变的串联重复序列(Ⅵ呵TR),包括小卫星 结果表明:第三外显子938处G—A的单核苷酸的 (rnjnisatellite)和微卫星(rnicrosatellite)。与前二代 突变造成了南阳牛、皮埃蒙特牛第三外显子扩增片 分子标记相比,SNPs具有以下特点:(1)数量多、覆 段多态性,秦川牛则不然。&等[s]根据牛生长激素 盖密度大,据估计平均每1000bp就会出现一个。目 受体基因cDNA序列和人类的生长激素受体基因 前已检测出93%的人类基因包含SNPS,98%的 序列设计特异性引物,利用PCR—RFLP技术,检测 SNPs其距离不超过5kb,因此,可以在几乎每个基 到了牛生长激素受体基因上的4个SNPs,它们分别 收稿日期:2006—12一05 作者简介:万亚琴(198

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