MicroRNA基因簇的多样性和进化.pdfVIP

中国科学 C 辑 :生命科学 2009 年 第 39 卷 第 1 期 : 114 ~ 120 SCIENCE IN CHINA PRESS MicroRNA 基因簇的多样性与进化 张雁峰, 张锐, 宿兵* 中国科学院昆明动物研究所, 遗传资源与进化国家重点实验室, 昆明 650223 * 联系人, E-mail: sub@ 收稿日期: 2008-09-27; 接受日期: 2008-11-28 国家自然科学基金重点项目(批准号: 306300130)资助 摘要 microRNA(miRNA)基因簇是一类 miRNA 基因在染色体上成簇排列形成的基因群. 关键词 在动植物基因组中, 已发现存在大量簇生排列的miRNA 基因. 然而这种簇生排列方式所具 miRNA 基因簇 有的功能意义尚不完全清楚. miRNA 基因簇常位于一个多顺反子内, 通过共表达在胚胎发 基因重复 适应性进化 育、细胞周期和细胞分化等诸多方面发挥协同调控的功能. 基于近些年来的研究进展, 本文 转座 综述了 miRNA 基因簇在动物染色体上分布的多样性, 表达与功能的协同性, 以及重复和转 座介导下miRNA 基因簇产生与消亡的适应性进化过程. microRNAs(miRNAs)是一类长度为 20~25 nt 的 有研究显示[7~10], miRNA的“种子区”(seed region)(第 内源性小RNA分子, 在转录后水平负调控基因的表 2~8 位碱基序列)与 3′UTR 的互补配对决定了miRNA 达和翻译[1]. 在动物细胞内, miRNA基因由RNA聚合 的抑制程度. [2] [ 3] [11,12] 酶 或者RNA聚合酶 转录产生初级miRNA转 大量研究表明, miRNA在发育时序性调控 、 录物(primary microRNAs)[4] , 经Drosha(RNase蛋白 细胞分化[13,14]、抗病毒免疫应答[15]、应激反应调节[16] 家族一成员)和DGCR8 形成的复合体[ 5]识别和切割, 等诸多方面起着至关重要的作用. 这种分子开关调控 形成具有发夹结构的长度约 7 0 ~ 9 0 n t 的前体 功能的异常将导致诸如癌症[17,18]、神经退行性疾病[19]、 miRNA(precursor microRNA). 在Exportin 5 的介导 心脏病[20]等疾病的产生. 下 [ 6] , 前体miRNA 从细胞核内被转运出核到细胞质 全基因组水平非编码 DNA 序列的研究发现, 中, 由另一个位于细胞质内的RNase酶——Dicer 识 miRNA 基因在染色体上的分布是非随机的, 许多 别发夹结构和切割后形成双链成熟的miRNA. 其中 miRNA基因紧密相邻, 排列成簇[21,22] . 关于簇生排列 一条链被快速降解(个别miRNA 除外, 比如miR-151 的miRNA有哪些特殊功能及它们的起源与进化过程 的两条链都发挥着功能), 剩余的一条链在一种称为 至今仍不是很清楚. 鉴于此, 本文结合最近几年关于 RNA诱导沉默复合体(RNA-induced silencing complex, miRNA基因簇的研究进展, 阐述了miRNA基因簇在 RISC) 的介导下按照不完