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全长序列的生物信息学分析 1 cDNA序列的分析 开放阅读框（ORF）的确定：NCBI中的ORF finder预测开放阅读框，开放阅读框为核酸序列中编码氨基酸的cDNA序列。找到ORF也意味着知道了氨基酸序列。 NCBI→resource（all resource）→Tools（ORF finder） 2 氨基酸序列的分析 氨基酸组成等蛋白质基本性质以及蛋白 质二、三级结构预测 http://www.expasy.ch/ ProtParam，GOR，SWISS-MODEL等 结构域分析： Pfam（http://pfam.sanger.ac.uk/） PROSITE （Expasy） 多序列比对：CLUSTALX（原理是同源性比对） 进化树分析：CLUSTALX, Mega * *