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噬菌体的研究进展与探讨 何俭周守山 广州金羿噬菌体生物技术有限公司中山大学药学院噬菌体研究室广州国际生物岛510006 摘要 我们汇总了其中的综述、研究论文／IN床报告、简报／观点等；既包含噬菌体研究的历史，也表现了近年来 噬菌体研究的现状。同时我们阐述了一些看法，如何挖掘噬菌体建模的作用。 关键词噬菌体建模 综述 噬菌体是生物圈中最为丰富的生物，也是原核生物生存的一个普遍特征。噬菌体就是感染细菌 的一种病毒。古生菌也被病毒感染，无论该病毒是否该称作“噬菌体”。噬菌体一直就被科学家用来 揭示基本分子生物学，如水平基因转移的载体、细菌进化的驱动器、诊断和遗传工具的源泉、以及 新型治疗性制剂。揭开噬菌体生物学以及与其宿主的关系，是认识细菌体系和开发利用的关键1。 噬菌体作为杀菌剂已有90年历史了，用来治疗人类和其他物种的细菌感染，称作噬菌体疗法。 在早期的不多研究中，有法国、波兰、美国、格鲁吉亚、和俄罗斯的宝贵历史经验2。 直到最近，关注用噬菌体生物防控动物的食物源性病原菌，在食品加工中使用。这似乎是受消 费需求驱动的，天然食物需求上升，以及事实上食源性细菌疾病在全球都持续发生，见于许多食物， 当中的有些食物(如新鲜的)目前还缺乏有效防控方法。同时，有些已成功获得当局批准，指定用 于食品的噬菌体产品，主要针对三类食源性病原菌：大肠埃希氏菌0157：H7、沙门氏菌物种、和单 核细胞增多症李斯特氏菌。将来，很可能有新的噬菌体产品3。利用裂解性噬菌体组成的鸡尾酒来针 对单个细菌，是一种惯常使用的方法11。 在噬菌体与细菌共存的数十亿年中，噬菌体进化出对我们有利的体系，其中之一便是裂解系统。 聚糖的基本键，而释放后裔噬菌体。溶菌酶现己成功用于各种动物模型中，防控粘膜表面和感染组 织中致病性抗生素耐药性细菌。超越抗生素的优势在于其病原菌的特异性，而不干扰正常菌群，细 菌耐受性机会低，杀灭粘膜表面生长中细菌的能力，以前不可能的一种能力。因此，溶菌酶可能是 多重抗生素耐药时代的一种极为需要的抗感染药4。 近来高效基因操作细菌的重组技术，便是得益于噬菌体衍生的重组蛋白，优势在于使用具有短 同源区的DNA底物，这种系统首先在大肠埃希氏菌中建立，后来也用在其他细菌上。现在广泛用于 许多不同体系的各种目的，并构建了染色体基因敲除、缺失、插入、点突变、以及活体克隆、细菌 ．30． 人工染色体和质粒诱变、和构建基因组文库。这些方法也可高效应用到噬菌体基因组的遗传修饰， 既包括前噬菌体状态，也包括裂解状态。永无止尽地收集完整测序的噬菌体，带来的问题会多过能 找到的答案，包括未知同源性未知功能的众多基因的未知功能。噬菌体基因组重组技术是找到这些 问题的核心，能够简便构建突变体，确定基因本质，阐明基因功能。反过来，我们认识噬菌体基因 组的进步，也会呈现类似重组技术，剖析众多其他遗传上细菌体系的本来面目5。 表1．近3年来的部分噬菌体实验研究(源自Bacteriophage) 作者(文献) 研究 J．Wittman#2 基因组与分子分析CMPl，编码早期和晚期功能两个成串基因分开转录 Paul 天然栖息与外源应用的T4类和T5类噬菌体，可降低羊肠道大肠埃希氏菌0157：H7水平 R．Rayal3 YvesBriersl4 巾-：MV裂解盒编码一种信号捕捉释放的内溶素与一种针孔蛋白，该盒为高度重叠基因的紧密排列，并 高度保守。 计数噬菌体粒子：传统噬斑检测与实时定量PCR的比较分析 S．Guentherl6 噬菌体生物防控单核细胞增多症李斯特氏菌(即开即食食品) J．D．willford 酶标发光噬菌体快速检测产志贺氏毒素的大肠埃希氏菌血清群 S．Hagensl8 报告噬菌体A51h：celB转换超热稳定糖苷酶，快速简便检测存活李斯特氏菌。利用了重组噬菌体技 术 M．Tamakoshi伸 基因组学与蛋白组学描述极端嗜热球菌的大型肌尾噬菌体由聊A Y．G．Kuznetsov20原子力显微技术研究T4噬菌体，AFM比衍射的极限还要高出1000倍，属于奈米级三维成像技术