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分子动力学模拟方法概述.pdf
《装备制造技术》 年第 期
2007 10
分子动力学模拟方法概述
申海兰,赵靖松
(西安电子科技大学机电工程学院,陕西 西安 )
710071
摘要:介绍了分子动力学模拟的基本原理及常用的原子间相互作用势,如Lennard-Jones势;论述了几种常用的有限差分算法,如Verlet
算法;说明了分子动力学模拟的几种系综及感兴趣的宏观统计量的提取。
关键词:分子动力学模拟;原子间相互作用势;有限差分算法;系综
中图分类号: 文献标识码: 文章编号:
O3 A 1672-545X(2007)10-0029-02
从统计物理学中衍生出来的分子动力学模拟方法(molec-
, ),实践证明是一种描述纳米科技
ulardynamicssimulationMDS 2势函数
研究对象的有效方法,得到越来越广泛的重视。所谓分子动力
学模拟,是指对于原子核和电子所构成的多体系统,用计算机 ( )势
2.1Lennard-JonesL-J
模拟原子核的运动过程,从而计算系统的结构和性质,其中每 [5]
最先提出了两体势的解析形式, 将它
Mie Lennard-Jones
一个原子核被视为在全部其他原子核和电子所提供的经验势 应用到铜的自扩散研究计算中。该两体势可表示为
[1]
场作用下按牛顿定律运动 。它被认为是本世纪以来除理论分 σ 12 σ 6
( ) ( )
#() - ()
析和实验观察之外的第三种科学研究手段,称之为“计算机实 r=4ε$ r r % 3
[2] 式中 和 是势参数,表示原子间距。通常为更好地
验”手段 ,在物理学、化学、生物学和材料科学等许多领域中得 ε σ r
拟合元素已有的实验数据,如结合能、晶格常数等, 势则使
到广泛地应用。 L-J
[6]
根据模拟对象的不同,将它分为平衡态分子动力学模拟 用一种普适的形式 。
(
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