蛋白质组学质谱数据预处理技术综述.pdfVIP

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2015-07-25 发布于安徽
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蛋白质组学质谱数据预处理技术综述.pdf

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勰卷3期中目生物医。学工程学报 voI．28No．3 2009 2009年6月 Ch／ne”Jouma／ofB／omed／m／Eng／needng June 蛋白质组学质谱数据预处理技术综述蚕辉洪文学。 (燕山大学生物医学工程系，秦皇岛o(铬004) 摘要：基于质谱技术的蛋白质组学数据分析，是识别新型生物标记物模式的有效手段。质谱仪检测的数据含有大量潜在信息，但数据很容易被系统误差和噪声污染。蛋白质组学质谱数据预处理的目的在于抑制噪声、数据简约和增加谱可比性等，是增强生物学相关信息的至关重要步骤。只依赖质谱仪中的软件进行数据预处理存在一定局限，需要额外工具辅助。从数据简约、谱线平滑、基线校正、标准化、谱峰提取与量化、谱峰联配等方面介绍典型的预处理技术，对预处理方法存在的问题进行讨论，并就发展趋势进行展望。关键词：蛋白质组学质谱；数据预处理；数据质量 inthe ofMass ProteomicsData ProgressPreprocessingSpectrometry MENGHlliHONGW-en．Xue。 066004) (Oepmm删ofB／omed／m／Eng／need增，Yamhan功由嘶，Q／nhuangdao Abstract：Mass based isa for novelbiomarkem Spectrometry powerful proteomicsanalysis approachidentifying in data contains patterns amountof biologicalsamples．Thoughproducedbyrn珊spectrometerspotentiallyhuge intefferrederromandnoisesdueto andinstrument information。they锄oftenby samplepreparation approximation． iscrucialfor datain theamountof Preprocessing m蝴spectrometryremovingnoises，reducing spectra data，making 118tofocusonthe relevant the comparable，and information．However，data allowing biologically preprocessingusing softwareoflnass isnot needssome toolsto extra