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利用DNA池和测序技术快速筛查SNPs及估算基因频率.pdf
遗 传 学 报 A c ta Gen e tica S in ica , Ap ril 2 005 , 32 (4 ) : 372 ~377 IS SN 0379 - 4 172
R ap id ly S c re en in g SN P s an d E s tim a tin g A lle lic
F re q u en c ie s b y DNA P o o lin g a n d S e q u en c in g
①
CU I J ia n Xun , DU Ho n g L i , ZHAN G X iQ u a n
( Co lle ge o f An mi a l S c ie n ce , So u th C h in a A g ricu ltu ra l U n ive rs ity , Gu a n gzho u 5 10642 , C h in a )
A b s tra c t: Fo u r b re e d s o f ch icken s (W h ite L e gho rn , Ya ng sh a n , Ta ih e S ilk ie s,W h ite R e ce s s ive Ro ck s) w ith d if
fe ren t e gg p ro du c tio n w e re app lie d to sc re en p o te n tia l s in g le nu c leo tide p o lym o rp h ism s ( SN P s) re la te d to rep ro
du c tio n tra it in d is ta l p a rt re g io n o f p ro la c tin gen e b a se d o n DNA p oo lin g a n d se qu e n c ing. E igh t SN P s ( C
2402 T, T2 192 C , C 2 16 1G , C 2 134 G , C 2 062 G , G 2 04 0A , A 1944 G a n d C 1884A ) w e re fo un d su cce s sfu lly in
th e fra gm e n t o f 1 02 8 bp a t th e d is ta l p a rt o f 5 ′fla nk in g re g io n. M o reo ve r, a s mi p le a n d rap id m e tho d to e s tmi a te
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a ccu ra c ie s o f e stmi a tio n fo r th e a lle lic fre qu e n c ie s o f C 24 02 T, C 2 16 1G , C 1884A , C 2 062 G a n d G 2 04 0A w e re
ve rifie d by com p a rin g w ith th e re su lts o f PCR R FL P o r PCR S SC P.
Ke y w o rd s : DNA p oo lin g; se qu en c ing; s in g le
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