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2015-07-25 发布于安徽
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基于自适应遗传算法特征基因选择.pdf

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第27卷第2期科技通报 V01．27No．2 2011年3月 BULLE7兀N0FSCIENCEANDTECHNOLOGY Mar．201l 基于自适应遗传算法的特征基因选择方文道，章坚民，刘登涛，杨阳 (杭州电子科技大学。杭州310018) 摘要：提出了一种基于自适应遗传算法的特征基因选择方法。首先建立一个基于Bhattacharyya距离的基因差异度模型，根据支持向量机(SVM)分类器的分类准确率选择出一个候选特征基因子集，然后利用自适应遗传算法搜索出一组最优特征基因组合，有效避免了遗传算法早熟收敛的缺陷，提高了全局寻优能力。对结肠癌基因表达谱数据进行仿真实验，分类准确率达到了94．6％，表明方法的可行性和有效性。关键词：基因表达谱；特征基因；自适应遗传算法；支持向量机中图分类号：1P13 文献标识码：A 文章编号：1001—7119(2011)02—0241-05 AFeatureGeneSelection Based Genetic On Algorithm AdaptiveAlgorithm FANG NG NG Wendao，ZHAJianmin，LIUDengtao，YAYang dianzi (Hangzhou 310018，China) university，Hangzhou afeatureselection basedon Genetic a gene Abstract：pmposed algorithm adaptive Algorithm．Firstly，createdgenetic modelbasedon distanceandchoosecandidatesetthat to difference a contained50 Bhattacharyya gene genesaccording SVMclassifier 80mefeature Genetic accuracy．Secondly，selectedgenesusingadaptive Algorithmavoidingpremature thismethodon on classificationrate coloncancer data，the at- convergence．Usingexperiment geneexpression accuracy rivesat94．6％whenthefeaturearefour．Sothe resultsshowthemethodisfeasibleandeffective． genes experiment vectormachine Keywords：geneexpression：featuregene：adaptivegeneticalgorithm：support 0 引言