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寻找肿瘤蛋白标记物:如何去除
酶和文献检索
生物通报道:从上世纪 30 年代来,癌症的死亡率没有得到很大的改观。科学家们希望能通过从复
杂的生物样本中分离鉴定出敏感特异的肿瘤特有的标记,来帮助肿瘤诊断,评估预后,评估肿瘤的分期,
复发,药物靶位点等。
来自加州大学洛杉矶分校的 David Wong 研究 不过无论如何,利用这种简易的奇思妙想,对
组希望能从人类唾液中寻找口腔鳞状细胞癌 于我们的实验研究还是大有裨益的,至于这种方法
(squamous cell carcinoma)和其它种类癌症的 的严谨性,还期待更多的实验来说明。
蛋白标记物,但是很快他们发现,唾液淀粉酶的干
另外来自约翰霍普金斯大学的 Akhilesh
扰严重。David Wong 表示,“很多次我们都不能
Pandey 在进行胰腺癌和乳腺癌的早期检测研究方
识别出低丰度的蛋白质组成分,比如信号因子,和
面,希望能找到潜在的肿瘤标记物,他也遇到了一
其它低分子量的蛋白”。
些问题:肿瘤标记物候选太多,Pandey 博士很难
为了摆脱这种困境,研究人员尝试了五种不同 从筛选出有效的标记物。这是一项由公益研究,需
的以抗体为基础的技术,但是依然不行。近期,终 要从 60 个不同的潜在标记物中筛选,但是要判断
于经过两年的努力,David Wong 研究组发现了一 哪个标记物最有效,确实是一个具有挑战性的工
种能消除酶影响的方法,并将这一成果公布在著名 作。
的方法学杂志《Electrophoresis》上。
Pandey 博士通过与其它科学家们合作,认真
这种方法其实只是在过滤唾液蛋白的过程中 研究了超过五万份胰腺癌相关的参考文献,从胰腺
添加了一步:在 1ml 玻璃注射器中装入 1g 马铃薯 癌的蛋白和 mRNA 清单入手,Pandey 等人将这些数
淀粉,注射器顶端安装着一个 0.45um 的过滤器, 据分入了几种胰腺癌的类型,搞清楚了是哪种细胞
将唾液从顶端注入,按压活塞让唾液通过注射器。 系会过量表达这种蛋白或 mRNA。之后又进行了更
这样就能达到去除唾液酶影响的效果了,Wong 博 为广泛的文献研究,发现了每个分子定位的组织,
士说,“这确实很管用。” 最后,研究人员分析了这些分子是否也存在于慢性
胰腺炎(Chronic Pancreatitis)患者体内,是否
之前一组以色列研究人员为了去除酶的影响,
是一种共存因子。这样研究人员就能得到一个类似
采用了 2D 电泳的方法,获得了 15 个之前未曾发现
wiki 的网络平台,癌症研究人员能将已发表的和
的,分子量接近 60kD 的蛋白,而 Wong的实验室则
未发表的结果录入其中,帮助分析候选物的有效
利用这种方法获得了同样的效果,“目前的数据,
性。
至少是 1D 电泳的数据表明,酶的蛋白条帯消失
了”,然而这种方法虽然显示,酶能结合在淀粉上, 这是筛选有效性的一种方法,可以小范围的替
但是否也
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