基于PCLinux蛋白序列分析系统的构建和应用.pdfVIP

第43卷第5期 中山大学学报(自然科学版) V01．43No．5 SUNYATSENI 2004 2004年9月 ACTASCIENTIARUMNATURALIUMUNlVERSlTATIS Sep． 基于PC／Linux蛋白序列分析系统的构建及应用米 寸树健，邓百煌，邓日强，杨彦臻，吴文言 (中山大学生命科学学院／／生物防治国家重点实验室／／ 海洋生物功能基因组开放实验室，广东广州510275) 摘 要：介绍利用常见的x86 以完成多种蛋白数据分析的大规模自动分析系统。该系统可自动完成从DNA序列中获取读码框、核酸序列向蛋 白序列的转化、在蛋白序列数据库中查找同源序列、序列录入数据库以及蛋白序列的等电点、亲／疏水位点、二 级结构等性质的分析、多个序列之间相似度和进化地位的分析，并对输出的结果数据利用Web服务器进行发布。 与传统的序列分析模式相比，此分析系统大大加速了对大规模数据信息的分析和利用