SELDI—TOF—MS技术检测心绞痛患者血浆蛋白指纹图谱的研究.pdfVIP

SELDI—TOF—MS技术检测心绞痛患者血浆蛋白指纹图谱的研究.pdf

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中国病理生理

中国病理生理杂志 ChineseJournalofPathophysiology 2009,25(2):389—391 · 389 · [文章编号] 1000—4718(2009)02—0389一O3 SELDI—ToF—MS技术检测心绞痛 患者血浆蛋 白指纹图谱的研究木 何文娟 , 胡 豫 , 张小平。, 余捷凯 , 洪 梅 , 郭 涛 , 宋善俊 (华中科技大学同济医学院协和医院血液病研究所 ,湖北省生物靶向治疗重点实验室, 湖北 武汉 430022;浙江大学附属第二医院肿瘤研究所,浙江杭州 310009) 【摘 要] 目的:采用表面增强激光解析/电离飞行时间质谱 (SELDI—TOF—MS)技术检测心绞痛患者血浆 蛋白质指纹图谱,从中筛选出特异的分子标志物。方法:应用SELDI—TOF—MS技术及金属离子螯合(IMAC一3) 蛋白质芯片对20例心绞痛患者和29例正常对照者血浆样本进行检测,借助生物信息学工具 (非线性的支持向量 机,SVM)提出心绞痛的诊断模型 ,并运用留一交叉验证法来评估该模型的判别效能。结果:用 SELDI—TOF—MS 技术筛选出由3个有显著差异的蛋白质峰 [质荷 比(m/z)分别为2667.3、5914.0和6890.5]组合构建的诊断模 型,可将20例心绞痛患者和29例正常人全部正确分组 ,诊断特异性和灵敏度均为 100%。结论:SELDI—TOF—MS 技术在心绞痛的诊断中具有较高灵敏度和特异性,发现的蛋白质峰可能在心绞痛的发病中起一定作用,血浆 中分子 标志物的发现有助于心绞痛的早期诊断。 [关键词] 心绞痛;表面增强激光解吸/电离飞行时间质谱;蛋白质组 [KEYWORDS] Anginapectofis;Surface—enhancedlaserdesorption/ionizationtime—of—flight;Proteome [中图分类号] R541.4 [文献标识码] A 表面增强激光解析/电离飞行时间质谱 (surface—en— 3.2%枸橼酸三钠抗凝管 (抗凝剂:全血为 1:9)中并混匀,采集 hancedlaserdesorptiort/ionization time——of——flightmassspec·· 后30min内将标本在4 下以3500r/win离心6win,将上层 trometry,SELDI—TOF—MS)技术是一种新兴的蛋 白组学研 血浆分装于已消毒的EP管中,保存于一80℃冰箱,待测。 究手段,它具有检测时间短、灵敏度高等特点…,分析蛋 白质 2 方法 的改变不仅可直接获得功能相关的标志物,而且还适用于标 2。1 标本准备 血浆标本在冰上解冻30rain后 ,以10000 准化和临床应用 ,现已应用于对疾病生物标志物的分析 r/min转速于4℃离心2win,取5 L样本分别加入96孔细 中 -53,然而,这一技术很少用于对心血管疾病特异性蛋白质 胞培养板上,用 10 L尿素缓冲液(9mol/L尿素,2%chaps, 的检测。本研究采用 SELDI仪及金属离子螯合(metal—ion 1%DTF)稀释后,4oC600r/min摇床 30min;快速加入 affinitychromatography,IMAC一3)蛋白质芯片检测心绞痛患 185 L醋酸钠 (pH4.0),4oC600r/win摇床2win。 者和正常对照者血浆蛋 白质指纹图谱,筛选出蛋白标志物并 2.2 蛋白芯片的预处理 将 100mmol/L硫酸铜 50 加 到8孔IMAC一3芯片池内,室温600r/win摇床 10min,甩干 建立诊断模型。 后加200IxL去离子水,室温600r/min摇床 1min,甩干后加 材 料 和 方 法 100mmol/L醋酸钠 (pH4.0)200p,L,室温600r/min摇床 5min,甩干后加200IxL去离子水室温6OOr/rain摇床 lrain, 1 材

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