第五章 真核生物基因组结构.ppt

一、真核基因组结构特点 真核基因组结构庞大 3×109bp、染色质、核膜 单顺反子 基因不连续性 断裂基因（interrupted gene）、内含子(intron)、 外显子(exon) 非编码区较多 多于编码序列(9:1) 含有大量重复序列 二、真核细胞与原核细胞在基因转录、翻译及DNA的空间结构方面存在以下几个方面的差异 ① 在真核细胞中，一条成熟的mRNA链只能翻译出一条多肽链，很少存在原核生物中常见的多基因操纵子形式。 ③ 高等真核细胞DNA中很大部分是不转录的，大部分真核细胞的基因中间还存在不被翻译的内含子。 ⑤ 在真核生物中，基因转录的调节区相对较大，它们可能远离启动子达几百个甚至上千个碱基对，这些调节区一般通过改变整个所控制基因5’上游区DNA构型来影响它与RNA聚合酶的结合能力。 在原核生物中，转录的调节区都很小，大都位于启动子上游不远处，调控蛋白结合到调节位点上可直接促进或抑制RNA聚合酶与它的结合。 ⑥ 真核生物的RNA在细胞核中合成，只有经转运穿过核膜，到达细胞质后，才能被翻译成蛋白质，原核生物中不存在这样严格的空间间隔。 三 基因组与C值 基因组( genome )：一个物种单倍体的染色体所携带的一整套基因称为该物种的基因组。 基因组是指遗传物质的总量，可以用C值表示。 C值（C value）：一个单倍体基因组的全部DNA含量。 对于 特定物种，C值是恒定的。 C值矛盾(C-value paradox) 　具体表现： 与预期的编码蛋白质的基因数量相比，基因组ＤＮＡ的含量过多，为什么？ 一些物种之间的复杂性变化范围并不大，但Ｃ值却有很大的变化范围。对于不同物种，C值差异较大。C值的大小与物种的结构组成和功能的复杂性没有严格的对应关系，这种现象称为C值矛盾。 　 四 基因的数量 差别很大 真核生物序列特征 （一）单一顺序 (nonrepetitive )：又称非重复序列，在一个基因组中只有一个拷贝，原核生物基因多数是单拷贝基因。 （二）重复顺序 (repetitive )：基因组中有多个拷贝，重复程度不同，真核生物的一些基因中，常含有大量的重复序列。 原核基因多数是单一顺序（unique-sequences），仅有少量的重复顺序。 真核基因组含少量单一顺序和大量重复顺序 短片段的重复序列按重复方式不同可分为三种类型： （1）正向重复(direct repeats) ：同一阅读方向上的重复； （2）反向重复(inverted repeats) ：反方向上的重复； （3）回文顺序 (Palindromic sequence) ：倒转重复，反转对称。 5‘ GTGAGCTCAC 3’ 3’ CACTCGAGTG 5’ 按重复程度不同可分为三种类型： 轻度重复序列（light repetitive）：在一个基因组中有2～10个拷贝，如组蛋白基因和酵母tRNA基因； 中度重复序列（moderately repetitive ）：有10至几百个拷贝，一般是不编码的序列，可能参与基因调控； 高度重复序列（highly repetitive）：有几百个到几百万个拷贝，如rRNA基因和某些tRNA基因。 高度重复序列 卫星DNA (satellite DNA) ：有些高度重复DNA序列的碱基组成和浮力密度同主体DNA有区别，在浮力密度梯度离心时，可形成不同于主体DNA的卫星带，称之为卫星DNA 。 卫星DNA：由长串联重复序列组成，一般对应于 染色体上的异染区域。 卫星DNA 小卫星DNA：由中等大小的串联重复序列组成， 位于靠近染色体末端的区域。 微卫星DNA：由更简单的重复单位组成的小序 列，分散于基因组中。 利用复性动力学鉴定基因组序列 零时复性序列 快速复性序列 中速复性序列 慢速复性序列 细胞器基因组 线粒体 叶绿体 第二节 断裂基因 在真核生物基因组中，一个基因的编码序列在DNA分子上是不连续的，被非编码序列所隔开，称为断裂基因或不连续基因。 外显子(Exon) 具有保守序列 对应基因的功能性单位 不同基因存在相关的外显子 内含子(Intron) 相位 类型 GT-AC 外显子与内含子的连接区序列很短，高度保守，是RNA剪接的信号序列