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1 MYB1、MYB2基因正反义序列的扩增
以cDNA为模板,分别用已加入酶切位点的正、反义全长基因引物扩增序列,PCR 反应体系如下:
c DNA(2.5 ng/μl) 1μl
Primer 1(10μM ) 2μl
Primer 2(10μM) 2μl
2×PCR Mix 25μl
dd H2O 补足至50μl
反应条件95℃ 3 min95℃ 30 sec;MYB1的Tm=60℃;MYB2的Tm=55℃ 30 sec ;32 Cycles;72℃ 90 sec;72℃ 10min。 PCR产物用0.1%琼脂糖凝胶电泳检测,扩增出MYB1 800bp、MYB2 600bp左右的片段,用TANGEN公司大量琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒回收目的片段。将回收的产物与Takara公司的pEASY-T1载体连接,转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,挑选单菌落进行PCR检测,阳性克隆送Invitrogen测序,经测序正反向序列无移码或突变发生。
2 正反义表达载体PBI121-senseMYB1、PBI121-antiMYB1、PBI121-senseMYB2的构建
分别提取pEASYT1-senseMYB1、pEASYT1-antiMYB1、pEASYT1-senseMYB2和PBI121质粒,电泳检测其亮度。各取50μl质粒,MYB1正反义、PBI121用BamHI/EcoRI进行双酶切,MYB2正义、PBI121用BamHI/XbaI进行双酶切,1.0%琼脂糖凝胶电泳检测酶切产物。对pEASYT1-senseMYB1、pEASYT1-antiMYB1、pEASYT1-senseMYB2质粒酶切后的小片段和PBI121质粒酶切后的大片段进行回收并连接,然后转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,对具有抗Kana的单菌落进行菌落PCR检测。阳性克隆送公司测序,进一步确定正反义序列无移码或突变发生,并且插入的方向正确。
3 表达载体转化农杆菌
表达载体公司测序正确,将鉴定正确的重组表达载体质粒用冻融法分别转化感受态农杆菌EHA105,经含有Kan(50mg/L)和Rif(50mg/L)的固体LB培养基筛选,挑取培养好的单菌落,摇菌,提取农杆菌转化子质粒DNA。农杆菌转化子质粒DNA再次用PCR方法进行鉴定,将鉴定为阳性的单菌落菌液保存于-70℃,备用。
4 农杆菌介导转化烟草
本实验用叶盘转化法,分别将pEASYT1-senseMYB1、pEASYT1-antiMYB1、pEASYT1-senseMYB2、PART、MYB-PART干涉质粒转化烟草叶片。阳性转基因植株正在筛选中。
5 基因的克隆
建立了蜡梅花各时期的转录组文库,并构建了中内被片的表达图谱,分析筛选基因的差异表达,充分利用文库克隆目标基因。用Tail PCR 或RACE扩增出以下全长,并用Pfam、ExPASy、PlantTDF、clustalx2、Mega等进行生物信息学分析。
编号 功能预测 ORF 蛋白保守域 实验进展 Cp99881 未知 1035bp Myb-like DNA-binding domain 正构建超表 Cp37378 抗寒HOS15/ 色素合成1737bp WD or beta-transducin repeat 正构建超表、克隆启动子 Cp32549 查尔酮合成类似/角质层蜡质1602bp FAE1/Type III polyketide synthase-like protein;3-Oxoacyl-[acyl-carrier-protein (ACP)] synthase III C terminal 正构建超表 Cp61803 转录组库注释错误,不属于MYB家族 不存在保守结构域 可继续验证其功能 Cp56471 Transcription repressor MYB5 1689bp Myb-like DNA-binding domain (41-139aa) 克隆出全长
编号 功能预测 ORF 蛋白保守域 实验进展 Cp58811 Alcohol dehydrogenase transcription factor Myb 2202 含有两个Myb/SANT-like DNA-binding domain 已克隆出全长 Cp49846 MYBTF可调控 DUO pollen 已克隆出2061bp, 不存在保守结构域 无终止子,3端需继续扩增
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