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中科院合肥分院浪潮集群使用规范简要说明.ppt
一:账号的申请和使用 二:登录、退出系统连接 二:登录、退出系统连接 三:属主目录使用 四:计算任务投放 五:存储空间使用 五:存储空间使用 六:软件安装及使用规范 六:软件安装及使用规范 六:软件安装及使用规范 六:软件安装及使用规范 七:关机和启动 八:维护人员联系方式 Inspur group 名称 版本 安装路径 Gaussian E01 /opt/issp2/g03 VASP 4.6.26 /opt/issp2/vasp Material Studio 4.4 /opt/issp2/Accelrys/MaterialsStudio44 wien2k /opt/issp2/wien2k 应用软件按照各研究室安装于/opt/研究室目录下,如issp2: 1. 遇有紧急情况和计划性维护工作时,系统将关机,请各用户接获通知后,应注意保证投放的任务能够在预定的关机时间前结束。 2. 系统重新启动后,具体应用项目组应安排人员及时启动相应服务。紧急关机并重新启动后,请各自应检查关机前计算任务的状态和结果,注意确保计算结果的无误和完整,并注意文件和目录(特别是高度重要的数据)是否出现的访问异常情况。 Inspur group Inspur group * 中国科学院合肥分院 浪潮集群使用规范 Inspur group 集群的软硬件配置 Inspur group 硬件信息 管理节点 NF5220*1 2*146G SAS raid1 登录节点 NF5220*1 2*146G SAS raid1 I/O节点 NF5220*1 2*146G SAS raid1 网格节点 NF5220*2 5*300G SAS raid5 计算节点 NX7140N*112 64G SSD 胖节点 NF560D2*2 1*146G SAS 存储 AS400 8*1T raid5 (1 热备盘) 管理网络 H3C千兆以太网 计算网络 Qlogic 9120 软件信息 操作系统 RedHat AS 5 update3 (内核2.6.18-128) 编译器/数学库 Intel C++/Fortran 编译器/ Intel MKL数学核心库 应用软件 Gaussian vasp Wien2k MPI实现 intel mpi 3.1 作业调度 TSJM/PBS 集群管理 浪潮天梭监管软件2.1 集群物理拓扑图 Inspur group 图例: 图例: Inspur group 内容提要 账号的申请和使用 登录、退出系统连接 属主目录使用 计算任务投放 存储空间使用 软件安装及使用规范 关机和启动 维护人员联系方式 1. 严禁使用集群账号及计算、存储资源进行与账号所属项目无关的任何活动和行为,违者必究并将视影响、损失轻重予以锁闭账号等处理。 2. 主机资源申请,联系系统管理员进行申请。管理员联系方式见本指南维护人员联系方式。 3. 建议避免公用账号,避免项目移交的时候数据混乱。 4. 人员发生调动时,请调动人员做好数据移交,并及时通知管理员申请权限改动。 5. 临时用户项目结束或阶段性完成时,请及时通知管理员清理/锁闭/注销临时账号及项目组成员账号。 6. 注销账号时请整理好用此账号建立的所有数据,做好移交及备份清理工作,并至少提前一天通知管理员。 7. 数据和程序(非公用程序)文件一律存放于自己的属主目录下,计算临时文件存放于工作目录下(lustre),计算临时文件不得存放于自己的属主目录下。 8. 个人账号只限个人使用,严禁将帐号和密码泄露给外单位和项目组外人员,公共组账号由管理员负责控制和使用分发。 9. 密码应定期(三个月)更换,建议8位以上并注意加强密码复杂度。 Inspur group 1. 登录方式 SSH: 缺省提供,该登录方式有一定强度的加密安全保证 软件可以使用Putty等 2. 文件上传与下载 SFTP: 缺省提供,暂不提供FTP方式 软件可以使用SecureFX、WinSCP等 3. 登录系统后的必要操作 使用mail命令,检查系统发送给用户的通知和信息 在属主目录下使用命令 du -kh | sort -n ,查看异常或较大的文件,并做相应的清理 Inspur group 4. 长时间误操作,请结束访问,避免占用系统资源 5. 结束系统访问必要操作 非停电、断网等意外设备故障导致,严禁在终端上直接关闭访问窗口或直接关闭终端电源实现结束系统访问。 SSH访问必需主动使用exit命令一到多次确保最终结束连接。 Inspur group 登陆天梭集群系统 ssh -l (your coun
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