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玉米waxy基因密码子偏好性分析.pdf
玉 米 科 学 , :
200816(2)16～21 JournalofMaizeSciences
文章编号:1005-0906(2008)02-0016-06
玉米waxy基因密码子偏好性分析
1,4 1,2,4 1,4 1,3,4
赵 耀 ,刘汉梅 ,顾 勇 ,黄玉碧
四川农业大学玉米所,四川 雅安 ; 四川农业大学原子能农业应用研究室,四川 雅安 ;
(1. 625014 2. 625014
四川农业大学农学院,四川 雅安 ; 西南作物基因资源与遗传改良教育部重点实验室 四川农业大学,四川 雅安
3. 625014 4. / 625014)
摘 要:运用 、 和 程序对玉米 基因的密码子进行了分析,将分析结果与大肠杆菌、酵
CHIPSCUSP CodonW waxy
母基因组的密码子偏好性进行比较。结果表明, 基因对一些密码子的使用存在明显的偏好性,特别偏好于使用
waxy
以 或 结尾的密码子,且玉米 基因与大肠杆菌、酵母的密码子偏爱性有较大差异,分析结果对玉米 基
G C waxy waxy
因在这两类表达系统中的表达具有一定指导意义。
关键词:玉米; 基因;密码子;偏好性
waxy
中图分类号:S513.035.3 文献标识码:A
AnalysisofCharacteristicofCodonUsageinwaxyGeneofZeamays
1,4 1,2,4 1,4 1,3,4
ZHAOYao,LIUHan-mei,GUYong,HUANGYu-bi
(1.MaizeResearchInstitute,SichuanAgriculturalUniversity,Yaan625014;
2.InstituteofIsotopeResearchLaboratory,SichuanAgriculturalUniversity,Yaan625014;
3.CollegeofAgronomy,SichuanAgriculturalUniversity,Yaan625014;
4.KeyLaboratoryofSouthwestCropGeneticResourceandImprovement,
SichuanAgriculturalUniversity,MinistryofEducation,Yaan625014,China)
Abstract:CodingsequenceofwaxygenewasanalyzedbyCodonW,CHIPS(CondonHeterozygosityinaProtein
CodingSequence)andCUSPS(Createacodonusagetable)programsforidentifyingcodonbiasandselectinghostsys-
temsforgeneexpression.Theresultswerec
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