甲型流感病毒H3抗原进化及变异规律的研究.pdf

甲型流感病毒H3抗原进化及变异规律研究 中文摘要 甲型流感病毒长期以来～直是威胁人类健康的重要病原体之一．对其变异规 律进行深入的分析研究在流感的防治工作中具有重要的现实意义。本研究借助近 年来发展起来的数据挖掘技术和进化树分析方法，从生物信息学的角度对流感病 毒H3抗原的变异规律迸行了系统研究，主要包括以下内容： 1．针对生物信息数据动态更新，不断增加的特点，确定采用数据拆分技术 进行样本采集，并使用聚类分析对序列的变异规律进行初步分析。两步聚类和自 组织图这两种新的聚类方法被加以应用，结果显示全部H3A1序列可以被清楚的 分为6类，各类在宿主间的分布特征清楚的反映了不同宿主序列间亲缘关系的远 近，而时间分布上则反映了H3亚型病毒在人间不断传播和变异的过程。 2．在聚类分析基础上，使用随机森林模型进行了人H3序列变异关键位点 的分析。借助于随机重排技术，最终筛选出了27个高度变异位点，除2号位点 外，其余26个均属于五个抗原决定区域之一。这一结果充分说明H3AI序列在 人间的变异主要应当是宿主的免疫屏障所驱动的。在变异的预测上，这些位点也 显示出了一定的作用。 3．为了进一步刻画H3序列的变异规律，本研究绘制出了全部序列的进化 树。分析结果显示进化