一PubMed数据库简介.ppt

一、PubMed数据库简介 PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的医学数据库查询系统。 PubMed的网址：/pubmed 特点：收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备，可少部分获取原文。 二、通过PubMed可检索到如下的信息 MEDLINE PreMedline 出版商提供的书目信息 NCBI其它数据库的相关记录 MEDLINE MEDLINE：是美国国立医学图书馆MEDLARS系统中最大的生物医学数据库，收录1966年以来70多个国家近4300种生物医学期刊的书目信息和著者文摘，每周更新。每条记录均带有[PubMed--Indexed for MEDLINE]标志。 出版商提供的书目信息：出版商提供的是整本期刊的信息，若有部分没有被MEDLINE收录，PubMed仍保存，在记录中做[PubMed--as supplied by publisher]的标记。 其它库 NCBI其它数据库的相关记录：PubMed建立了与NCBI其他数据库之间联系。它们是双向网络互连的关系（见下页图）。 三、PubMed页面的结构 登录 PubMed主页 /entrez/query.fcgi/PubMed/ PubMed页面的结构 NCBI数据库 Nucleotide：DNA序列数据库 Protein：蛋白质序列数据库 Genome：基因组序列数据库 Structure：分子结构模型数据库 Popset：种群、种系发生或突变序列数据库 Taxonomy：微生物类别数据库 OMIM：人类孟德尔遗传学在线数据库。 PubMed辅助检索工具 Limits （限制功能） Preview/Index（预览/索引） History（检索史） Clipboard（剪贴板或文件夹） Details（明细栏） 四、PubMed的基本检索功能 词语检索及自动词语匹配 作者姓名检索 杂志名称检索 截词检索 短语检索 逻辑运算符检索 四、PubMed的基本检索功能（一） 词语检索及自动词语匹配 在检索框中键入一到多个检索词，按“GO”键，即显示检索结果。 “clear”按钮可以帮你清除查询框中的内容，然后开始一个新的查询。 四、PubMed的基本检索功能（一） 自动词语匹配 PubMed能自动利用它的“自动词语匹配”功能将重要的词语结合在一起，并将不规范的词语转换成规范的用词。 如：输入vitamin c common cold，系统会将自动转换成(“ascorbic acid”[MeSH Terms] OR vitamin c[Text Word]) AND (“common cold”[MeSH Terms] OR common cold [Text Word])进行检索。这种处理能使检索结果更精确和全面。 四、PubMed的基本检索功能（二） 作者姓名检索 在检索框内按照姓+名缩写(不用标点)的格式键入作者姓名，如Smith ja，系统会自动在作者字段内进行检索。 如果想进行更精确的检索，可以用双引号将作者名引起来，再加[au]，如“smith j”[au] 四、PubMed的基本检索功能（三） 杂志名检索 在检索框中键入杂志全名molecular biology of the cell 也可以直接键入Medline的期刊标准缩写形式，如：mol boil cell， 键入刊物的ISSN(国际标准出版物代码）进行检索，如1059-1524。 Cell transplantation [ta] 四、PubMed的基本检索功能（四） 截词检索 可利用系统的截词功能获取更多的相关文献，这与Medline光盘中截词检索的用法是相同的：截词符“*”可代表多个字符，将*加在检索词后可以表示对所有以该词开头的词进行检索；如：bacter*，可以检出bacter, bacteria, bacterium, bacteriophage等词。 PubMed一次最多可以检索出150个词形变异词。如staph*，可以产生150个起作用，可以采取加长词根的方法进行检索。 四、PubMed的基本检索功能（五） 短语检索 PubMed首先将键入的检索词（词组）视为合理的短语在短语索引中进行查找。如：poison ivy，PubMed将其视为词组进行查找。当PubMed没有找到该词组时，系统将自动把两个词分开进行检索； 如果不希望系统将两词分开，则需要用“”把检索词括起来，即强迫PubMed进行词组检索。如“single cell”。 当用双引号括起词语时，PubMed将不执行自动词语匹配功能。 四、PubMed的基本检索功能（六） 逻辑运算符检索 在检索框中输入逻辑