猪背最长肌中肌肉生长和脂肪沉积相关基因的差异表达和主成分分析.pdfVIP

ISSN 中国生物化学与分子生物学报 2008 年 1 月 CN 　113870Q Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology 24 ( 1) :46～54 猪背最长肌中肌肉生长和脂肪沉积相关基因的 差异表达和主成分分析 1) 1) 1) 2) 2) 1) 1) 李明洲 , 　李学伟 , 　朱 　砺 , 　滕晓坤 , 　肖华胜 , 　李 　强 , 　陈　磊 ( 1) 四川农业大学动物科技学院 , 雅安 　625014 ; 2) 生物芯片上海国家工程研究中心 , 上海 　201203) 摘要 　骨骼肌细胞和脂肪细胞在分化生长速度上相对竞争的平衡点是猪肉质和胴体性状的决定因 素. 利用 Oligo 功能分类芯片检测了瘦肉型的长白猪和脂肪型的太湖猪在初生 、1 、2 、3 、4 和 5 月龄间 背最长肌中肌肉生长和脂肪沉积相关基因的动态表达变化. 差异表达分析结果显示 ,在初生至 5 月 龄的品种间分别有 15 、16 、11 、13 、18 和 20 个基因的表达差异倍数大于 2 倍. 品种内的方差分析表 ( 明 ,长白猪分别有 18 和 22 个基因 ,太湖猪分别有 3 和 7 个基因在月龄间的表达差异达极显著 P ) ( ) 001 和显著水平 P 005 . 主成分分析结果显示 ,先降后升是两品种内最具代表性的基因表达模 式 ,且长白猪和太湖猪分别有 7 和 6 个基因的表达模式明显偏离其他基因 ,提示其可能受到了重要 的调控. 此外 ,5 个差异表达基因的荧光定量 RTPCR 验证结果均与芯片结果呈正相关趋势. 以上 结果筛选出了对于猪肉质和胴体性状可能具有重要影响 ,值得深入研究的一些候选基因 ,为深入研 究生长发育过程中参与肌纤维生长和脂肪酸合成关键基因的表达变化规律和互作调控机制提供了 基础数据. 关键词 　猪 ;基因芯片 ;肌肉;脂肪 ;基因差异表达 ;主成分分析 中图分类号 　Q756 Differential Expression and Principal Component Analysis of Genes Related to Muscle Growth and Adipose Deposition in Porcine Longissimus Dorsi Muscle 1) 1) 1) 2) 2) LI MingZhou , LI XueWei , ZHU Li , TENG XiaoKun , XIAO HuaSheng , 1) 1)