代谢网络结构与功能的复杂网络分析.pdfVIP

第28卷 第 3期 计算机与应用化学 VO1l28．NO．3 2011年 3月28日 ComputersandAppliedChem istry M arch．2O11 代谢网络结构与功能的复杂网络分析 丁德武 ，黄海生 ，陆克中 ，何小青 ，计博婧 (1．池州学院数学与计算机科学系，安徽，池州，247000； 2．池州学院环境科学系，安徽 ，池州 ，247000) 摘要：细胞的新陈代谢过程可以抽象地描述成交互的复杂网络，越来越多的证据表 明这种描述和分析有助于理解代谢网络的结 构和功能。本文首先对高质量金黄色葡萄球菌 (Stap lococcusaureus)代谢网络数据进行整理，构建了该网络中的所有代谢反应 列表 。随后用代谢物 图(即节点表示代谢物，连线表示代谢反应)来表示这些反应，形成的网络包含 了855个节点和 1353条连 线。最后用复杂网络理论分析了该网络的全局结构特征、巨强连通体的