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Cla_Factor一个基于支持向量机的人类转录因子分类方法.pdf
ISSN
计算机研究与发展 1000—1239／CN11—1777／TP
of Researchand
Journal
Computer Devel@ment
Cla—Factor：一个基于支持向量机的人类转录因子分类方法
周 强 陈 越 熊 赘 朱扬勇
(复旦大学计算机与信息技术系 上海200433)
(zhouqiangl@gmail．tom)
Cla—Factor：AntoHuman FactorsClassificationwith
Approach Transcription
VectorMachine
Support
Zhu
Zhou Yun，and
Qiang，ChenYue，Xiong Yangyong
and
(DepartmentofComputingInformationTechnology，FudanUniversity，Shanghai200433)
Identificationof factorsis to mechanism
Abstract the of
transcriptionveryimportantunderstanding gene—
factorscanbeclassifiedinto four tothestructureof
regulation．Transcription mainlycategoriesaccording
domain．Withthe increaseinnew into is
DNA-binding rapid proteinsequencesenteringdatabanks，it
toestablisha toolfor and factors．
vitallyimportant highthroughputpredictingclassifyingtranscprition
inthis isan namedCla_Factorfor factorswithSVM．Ituses
Given paperalgorithm classifyingtranscription
functionaldomain asthe fora onthis
sequence．Based
compositionrepresentationprotein representation，a
canbedefinedasavectorina whereeachofthefunctionaldomains
proteinsequence high—dimensionalspace
derivedfromthe universeservesasavetorbase．Thenthe vectormachine(SVM)
protein support
successratesareobtained cross
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