植物转录因子最新研究方法.pdfVIP

1l8 生 技 术 通 讯 v LETTERSINB10TECHNOLOGY Vol． 2·4斗Nlo．·l1JJan．，，2u0ll3 TT H doi：10．3969~．issn．1009-0002．2013．01．028 综 述 植物转录 因子最新研究方法 王传琦，孔稳稳，李晶 东北农业大学 生命科学学院，黑龙江 哈尔滨 150030 [摘要] 转录因子可以调控众多下游基因的表达，在植物的生长发育、代谢及对外界环境的反应中起着重要作用。 我们结合近年来植物转录 因子的研究进展 ，归纳分析 了高等植物转录 因子研究的主要策略和最新的技术方法，并从 生物信息学分析、瞬间转化技术的应用、突变体表型分析及调控 网络等几个方面进行 了全面阐述 ，为植物转录因子 的 预测 、功能鉴定及靶基因分析等相关研究提供理论和方法的参考 。 [关键词] 植物转录 因子；功能分析 ；生物信息学；调控网络；策略与方法 [中图分类号] Q943．2 [文献标识码] A [文章编号] 1009—0002(2013)0l一01l8—06 CurrentResearch M ethod ofTranscription Factors in Plants WANGChuan-Qi，KONGWen-Wen，LIjing CollegeofLifeScience，NortheastAgriculturalUniversity，Harbin 150030，China Correspondingauthor．E—mail：lijing@neau．edu．cn [Abstract] Transcriptionfactorsregulatevastdownstream genesandplayanimportantroleinregulationofdevel— opment，metabolism and response to environmentin plants．In this review，we analyzed the recentresearch prog— ressin planttranscription factors and introduced strategiesand currentdeveloped methodology．The main strategies including bioinformatic analysis，transienttransfection，phenotypic mutation and regulatory network were discussed． Ourreview may provide some usefulinstruction forthe future research oftranscription factor in prediction，func— tionalanalysisand identification oftargets． [Keywords] planttranscriptionfactor；functionalanalysis；bioinformatics；regulatorynetwork；strategyandmethod— ology 转录因子 (transcriptionfactor，TF)又称反式作 自植物中最早的玉米转录因子被报道 以来 ，已 用 因子 ，是直接或间接与基 因启动子 区域 中顺式作 发现植物 中存在大量转录因子 。根据模式植物拟南 用元件发生特异性相互作用 ，并对基 因转录的起始 芥信息资源库TAIR提供的数据分析，拟南芥基因组 进行调控 的一类蛋白质。转录因子一般具有4个功 中包含27235个编码蛋白的基因，其 中2000个以上 能结构域 ，即DN